小儿尤其是婴儿，由于牛奶蛋白耐受不良常有腹泻、吐奶或肠绞痛，情绪不安等，影响小儿的营养和正常的生长发育。其根源可能是对牛奶蛋白过敏或乳糖不耐受。
小儿牛奶蛋白过敏及耐受不良是同一个疾病，不同国家使用不同的名称。大约有1％-2％的小儿患病，约57％发生于生后第1个月的婴儿。3个月内婴儿母乳缺乏，用牛奶或奶粉喂养后有难治性、非感染性腹泻超过2周，即应考虑有本病的可能。有这种现象存在时，更换牛奶、奶粉的品种仍然没有好转，此时应在医生指导下，改换婴儿豆奶粉喂养，会有明显的效果。
牛奶中含有5种蛋白质，即酪蛋白、α-乳白蛋白、β-乳球蛋白、牛血清蛋白和γ-球蛋白。对婴儿来说都是异种蛋白，可引起变态反应，β-乳球蛋白是最常损害小肠粘膜的蛋白质，乳白蛋白是主要的过敏原。婴儿的小肠可吸收上述5种牛奶蛋白质，所以容易过敏。牛奶过敏又可导致乳糖吸收不良，吃牛奶后有各种胃肠道症状，腹泻、腹胀、腹痛等，由于不能水解乳糖，小肠腔内发生紊乱，引起酸性产气性腹泻。牛奶蛋白过敏与乳糖不耐受常同时存在。
因此，专家建议不能接受正常喂养的孩子应选用婴儿豆奶粉。大豆本身含有蛋白质35％- 43％，富含钾、钙。镁、磷、铁元素及维生素B1、B2、泛酸、生物素等营养物质。其所含铁有80％可为人体利用，远较牛奶铁的利用率高。如：爱尔素（Nursoy）是美国惠氏药厂专为牛奶不耐受小儿设计配制的，不含牛奶的婴儿豆奶粉。一般2岁后牛奶过敏已少见，应过渡到其他适合于年龄要求的配制奶粉。
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