化学鉴定
⑴取胚乳切片，加硫钒酸1滴，显蓝紫色（番木鳖碱反应）；另取切片加浓硝酸，显橙红色。（马钱子碱反应）
⑵取马钱子粗粉1g，加乙醇15ml，冷浸2h，滤液蒸干，加1mol/L盐酸溶解，以氧氢化铵试液碱化，氯仿提取，氯仿液再以1mol/L盐酸提取，酸液中加锌粉及浓盐酸，水浴加热5min，冷后加亚硝酸溶液1滴，即显樱红色。（番木鳖碱反应）
（3）薄层层析：取粉末0.5g，加氯仿-乙醇（10:1)混合液5ml及浓氨水溶液0.5ml，振摇5min，放置2h，滤液供试，另取番木鳖碱、马钱子碱加氯仿溶解，制成每1ml各含2mg的混合液作对照。各取10μl分别点样于同一硅胶G板上，以甲苯-丙酮-乙醇-浓氨溶液（40:50:6:4) 展开15cm，取出晾干，喷以稀碘化铋试液，对照品显两橙色斑点，马钱子碱在下方，番木鳖碱在上方，供试品显相同的色斑
【附注】：同属植物云南马钱S.pierriana A.W.Hill.的种子亦作马钱子入药。
化学成分
马钱子苷的分子式
马钱种子含多种生物碱，可分为三种类型：
①“正”系列（normal series ）生物碱：番木鳖碱（strychnine），马钱子碱（brucine），异番木鳖碱（isostrychnine），异马钱子碱（isobrucine），番木鳖碱N-氧化物（strychnine N－oxide），马钱子碱N-氧化物（brucine N－oxide），β-可鲁勃林（β－colubrine），16-羟基-β-可鲁勃林（16－hydroxy-β-colubrine），16-羟基-α-可鲁勃林。
②“伪”系列（pseudo series ）生物碱：伪番木鳖碱（pseudo-strychnine），伪马钱子碱（pseudobrucine）。
③“N”-甲基伪”系列（N－methylpseudo series）
生物碱：N-甲基-断-伪番木鳖碱（icajine），番木鳖次碱（vomicine），N-甲基-断-伪马钱子碱（no-vacine）。
种子所含生物碱以“正”系列为主[1-3]。种子经高温加热（220～260℃，3min），剧毒成分番木鳖碱、马钱子碱含量明显降低，而异番木鳖碱、异马钱子碱、番木鳖碱N-氧化物及马钱子碱N-氧化物含量增高[3].
根皮、根木质部含“正”系列生物碱为主，茎皮含“伪”及“N-甲基伪”系列生物碱为主，叶则含“N-甲基伪”系列生物碱为主[1]。果皮、果肉均含番木鳖碱，马钱子碱，4-羟基番木鳖碱（4-hydroxystrychnine），番木鳖碱N-氧化物，马钱子碱N-氧化物，伪番木鳖碱，伪马钱子碱，N-甲基-断-伪番木鳖碱，番木鳖次碱，N-甲基-断-伪马钱子碱，果肉另含β-可鲁勃林。果肉还含环烯醚单萜类（iridoid）化合物：马钱子甙（loganin），马钱子甙酸（lo－ganic acid），去氧马钱子甙（deoxyloganin），马钱子酮甙（ketolo－ganin），开链马钱子甙（secologanin）[4]。
长籽马钱种子含多种生物碱，可分为三种类型：
①“正”系列生物碱：4-羟基-3-甲氧基-番木鳖碱（4- hydroxy－3－methoxystrychnine），番木鳖碱，马钱子碱，4-羟基番木鳖碱，番木鳖碱N-氧化物，α-可鲁勃林。
②“伪”系列生物碱：伪番木鳖碱，伪马钱子碱。
③“N-甲基伪”系列生物碱：N-甲基-断-伪番木鳖碱，番木鳖次碱，N-甲基-断-伪马钱子碱及4-羟基-3-甲氧基-N-甲基-断-伪番木鳖碱（4－hydroxy－3－methoxy-N－methyl-sec－pseu－dostrychnine）[5,6]。
种子所含生物碱以“正”系列为主[5]叶则含“N-甲基伪”系列生物碱为主[5]。
此外，叶还含有N-氰基-断-伪番木鳖碱（N-cyano-sec－pseudostrychnine）及N-氰基-断-伪马钱子碱（N－cyano-sec-pseu－dobrucine）[7，8]。
