1. 基肥 冬瓜的生长期长，吸肥的高峰期也长，应当十分重视基肥的施用，基肥应以营养全面，养分供应时间长的优质有机肥为主。冬瓜基肥每667平方米一般施优质圈肥5000千克以上。基肥的施入可与整地相结合施入，也有的地方采取整畦后沟施。冬瓜的基肥施入量多，特别是有机肥，一定要充分腐熟，以免伤害根系。在北方地区冬瓜地在冬前应耕翻晒垡，施入有机肥后再复耕耙匀，以饼肥或油渣等作基肥的充分发酵后在定植前穴施，也可与过磷酸钙等混合后穴施。基肥较少的地区，可沟施或穴施；基肥较多，最好一半撒施，别一半穴施。
2. 追肥 追肥对冬瓜的生长和产量形成也十分重要。南方地区追肥多用稀粪水，而北方则用充分腐熟的优质厩肥和速效化肥，整个生育期追施2-3次。前期追肥以氮为主，而中后期则以氮、磷、钾复合速效肥为主。冬瓜追肥时期因品种栽培方式不同而有差别。冬瓜多为直播栽培，底肥充足时，第一次追肥就不必过早。南方地区一般在第三真叶展平后，北方地区多在第5-6片真叶期进行第一次追肥。抽蔓期一般在蔓长1米左右和2米左右各追施一次稀肥，目的是促进茎蔓生长。第四次追肥是在开花结果期，这次施肥对冬瓜生长十分重要，一般在瓜坐住后进行，以防落花落果，同时氮、磷、钾肥料要齐全。冬贮冬瓜特别是大型果品种冬瓜，在采收前10-15天停止肥水供应，目的是减少瓜内水分，增加耐贮性。冬瓜的追肥应本着前少后多的原则，一般抽蔓以前，追肥量占30％左右，开花结果期占70％。追肥以穴施或条施为宜，每667平方米共需尿素45千克，过磷酸钙50千克，硫酸钾25千克，有条件的地区，追肥也可用优质有机肥（如豆饼，每667平方米75千克，稀粪水4000千克）。
