水解温度不能太高，一般控制在80-90℃，温度高了，会促进大量油脂皂化及维生素遭到破坏，另外，蛋白质凝固得较为紧密，势必要消耗较多的碱量，并延长水解时间。不仅如此，而且油脂在高温下，骤然与碱接触，就要产生大量的肥皂，增加肝油的消耗，而形成乳浊液，给分离肝油带来了困难。因此在生产中采用二级温度制，先加热到50℃左右，再行加碱，最后提高温度到80-90℃。碱液的加入应分为二次进行，这样可防止多量碱与油脂皂化和因一次加碱过多而使溶液的PH值超过所需要范围。
碱液的加入应分为二次进行这样可防止多量碱与油脂皂化和因一次加碱过多而使溶液的PH超过所需要范围。
鱼肝水解的时间，以肝的种类不同而异，一般为1-1.5小时，少脂肝有时需达2-3小时。
水解锅一般采用夹层不锈钢锅。
（3）肝油的分离与洗涤：由水解锅出来的液汁，其主要组成为油、水溶液和肝渣。在离心分离时，由于比重不同分为三层，比重大的肝渣在最外层，附着于离心机的内壁上，油在最内层，而水溶液在中间一层，油和水溶液可连续不断地分别从导管流出，而肝渣需要拆洗卸出。离心之前需要加热，但温度不宜过高，一般不超过90℃。
当发现水解液的乳胶体不能使油分离时，可加入食盐水而达到分离的目的。
在第一次分离出的肝油中，尚含有部分的水、肝渣和肥皂等杂质，因此还相当混浊，需用盐水洗涤2-3次。加盐破坏乳胶体，盐析肥皂，而且也增大水溶液的比重，加水可洗涤油中的碱和肝渣。第一次洗涤用5%的盐水，盐水与油的比例为1：1，水温约80℃左右为宜。第二次洗涤，盐水可浓一些，为5-10%，盐水量为油量的1/2。温度80℃。洗涤次数根据分出鱼肝油的质量而定，必要时可进行第三次洗涤。肝油提出以后的肝渣，可用来造肝渣胨、酱油、氨基酸等水解产品，也可直接用作饲料或肥料。
（4）鱼肝油的低温处理：这是一项重要的精制工序，是鱼肝油的低温处理（脱硬脂）。由于鱼肝油在贮藏过程中，到低温季节时，其中所含的较高凝点的某油脂会结晶析出，这样就降低了鱼肝油的商品价值。因此在肝油包装前，必须进行低温处理，使其中较高凝固点的某油脂充分析出，经过压滤之后所得的肝油，即是在冬季仍可保持清沏状态。
根据《中华人民共和国药典》规定，鱼肝油在0℃时不得有沉淀析出，而压滤效果差，缓慢冷却时结晶粒子大，而压滤效果高。故在实际生产中，鱼肝油需要在5-7天的时间内逐渐降温到1-2℃，然后再置于更低的冷库内降到-2至-3℃，所用时间也要3-5天。
已经冷却并析出沉淀的肝油，采用板框机分离清油。压滤后所得的硬脂酸甘油脂是极有用的工业原料，如制肥皂、蜡烛、涂料等，还可作食用。
3．直火熔出法提制鱼肝油
此法虽属比较原始的熔油方法，但因设备简单，生产成本低，尤其新鲜原料能得到及时加工，提制的鱼肝油质量较好，所以，我国渔民多采用此法熔炼海豚油和鱼类内脏油。其原理是借加热的方法将油脂原料的组织细胞破坏，从而分离出油脂。由于脂肪组织的细胞内大部分是油脂，而且这种油脂主要是以游离状存在的，因此，一旦细胞破裂，这种油脂便很容易地分离出来。使细胞破裂的方法很多，但最基本的、最具有实际意义的是热处理的方法。
直火熔出法又可分干煎和水煎两种。干煎容易将原料烧焦降低油脂的质量，而且在缺水的情况下油脂难以充分熔出；水煎法的优点是不仅不会把原料烧焦，而且因原料组织的表面有亲水性质，当有充分的水存在时，可减少物料的含水量及其性质而异。一般加水量为原料重的25-30%，如果用海水熔出效果可以提高。
在熔油过程中，为避免沸腾时有水溢出，加料到锅中不应太满，一般应使锅中水面保持在锅缘以下15-20厘米。加热温度应该逐渐升高，搅拌不应太快，以免油脂与蛋白质等形成胶体。
一般来说，熔出分三个阶段。第一阶段是将锅中内容物在1小时内加热到50℃左右。然后升温65-75℃，并维持2小时左右，这期间应时常搅拌，这属于第二阶段。最后阶段是油脂析出阶段，温度要达到沸点，时间一般在1小时左右。
为了有效地分离树脂，熔出后应将其混合物静置2小时左右，如果在静置过程中，油脂不能上浮或上浮迟缓，可加些食盐，用量为原料的2-7%。
4．发酵法提制鱼肝油 此法是借酶类分解蛋白质细胞以分离油脂的方法，适用于各种鱼肝油的提取。
在剖割鲨鱼或其它鱼类时，把鱼肝取出，先摘除胆囊，用刀切成较大的块，放入清水中两手轻轻挤压，排出污血，再用刀切成3厘米左右的小方块，加15-20%的细盐，装入桶或缸内搅拌均匀，密封，防止阳光直接照射，以免氧化酸败，经过数月的发酵，肝油便分离出来浮在上层，渣滓和盐液便沉在底层。加盐的目的主要是防止鱼肝中的非脂肪的有机成分腐败，而影响肝油的质量。
