由于脱毒苗木的特殊性，要求在建园时，相应地采取一些措施，以保证脱毒树体的正常生长发育。
1)不用带毒接穗进行改接，以防病毒侵染和传播。用脱毒接穗给带毒品种改接，改接后树体仍为带毒植株。
2)不能和带毒苗木混栽。原来的苹果、梨园改种脱毒苗，须闲置1年。病毒可以通过工具与树本接触，根际交接等途径传染，相邻不同类型的果园，最好有一定的间隔距离。
3)使用工具必须专用，经常消毒。
