选择消毒药物时，一要考虑猪场的常见疫病种类、流行情况及消毒对象、消毒设备、猪场条件等，选择适合自身实际情况两种或两种以上不同性质的消毒药物。二要充分考虑本地区的疫病流行情况和疫病的可能发展趋势，选择储备和使用两种和两种以上不同性质的消毒药物。三是定期开展消毒药物的消毒效果检测，依据实际的消毒效果来选择较为理想的消毒药物。
选择消毒药品时，要选效力强，效果广泛，生效快且持久，不易受有机物及盐类影响的药品。特别是在疫病发生期间，更应精心选择和使用消毒剂，特别是对病毒性传染病，更要选用品质有保障的产品。使用前充分了解消毒剂的特性，提前订好消毒计划，结合季节、天气、充分考虑适用对象、场合。
实践证明，消毒液温度每升高10℃，消毒效果可增加2～3倍，但碘福乐、次录酸钠等的消毒力在20℃左右最高，超过则有效成分会逸失。
不混合使用不同消毒药。混合使用只会使消毒效果降低，如需要用数种，则单独使用数日再使用另一种消毒剂。
消毒不是万能的，完整的防疫措施必须配合卫生管理、免疫及药物防治，才能控制疾病发生。
