2013年，我国畜牧业接连遭遇生猪价格提前快速下跌、人感染H7N9流感病例突袭家禽业、奶牛养殖效益低下导致大批散养户弃养退出等一系列挑战。面对各种严峻的不利形势，各级畜牧兽医部门连续奋战，发展生产保供给，强化监管保安全，综合施策保生态，救助禽业渡难关，力保畜牧业基础生产能力在稳定中继续加强。
加速产业转型升级，生产能力日趋稳定。面对上半年畜牧业严峻形势，农业部积极协调有关部门，争取加大政策支持力度，组织各级畜牧兽医部门抓紧落实有关政策，强化信息监测预警和技术指导服务，加大产业结构优化调整力度，把提升产业素质作为提高综合生产能力的突破口。加快推进标准化规模养殖，散户加快退出，经营主体面对产业波动更加理性，产业型态更加成熟定型，今年上半年在猪价持续下跌时并未出现大量淘汰母猪现象，10月份生猪存栏和能繁母猪存栏与前4年同期平均水平相比，分别高1.9%和0.5%。持续提高产业化水平，大型一体化龙头企业不断涌现，龙头企业与养殖场户利益联结更加紧密，H7N9流感事件中龙头企业坚持亏本回购，合作农户损失大幅降低，有效保护了养殖积极性。不断完善政策支持体系，财政资金支持力度加大，市场调控手段加强，产业发展基础更加坚实。针对H7N9流感事件，推动出台祖代鸡补贴政策，安排3亿元保护肉鸡基础生产能力；针对生猪价格快速下跌，及时启动生猪调控预案，加大收储力度，引导市场预期，促进了生猪价格的稳定；针对牛羊肉供给偏紧现状，推动出台《全国牛羊肉生产发展规划（2013―2020年）》。随着畜牧业的转型发展，畜产品综合生产能力稳步提升，未来市场供应无虞，产品类型将更加丰富。
监管力度持续加大，质量安全水平稳步提升。今年以来，农业部严格实施饲料质量安全检测计划和养殖环节“瘦肉精”监测计划，深入开展饲料风险安全评估和养殖环节质量安全专项整治。组织开展生鲜乳收购运输环节专项整治，全面开展生鲜乳质量安全监测计划。生鲜乳三聚氰胺检测合格率连续5年保持100%；养殖环节“瘦肉精”监测合格率100%，饲料环节“瘦肉精”监测合格率100%，饲料产品质量卫生指标监测合格率96.03%，全年未发生重大生鲜乳和饲料质量安全事件，畜产品总体质量安全处于历史最好水平。
政策效应逐步显现，草原生态加快恢复。全面落实草原生态保护补助奖励机制政策，组织实施草原保护建设重大工程项目。全年落实下达草原保护建设资金207.75亿元，完成种草改良1.76亿亩，建设草原围栏7407万亩，累计落实草原承包42.5亿亩，草原禁牧面积14.4亿亩，草畜平衡面积26亿亩。草原生态环境加剧恶化的势头得到遏制。
