水稻破口期要重点防治稻飞虱、稻纵卷叶螟、螟虫、穗瘟、稻曲病等穗期病虫害。根据水稻品种特性、主要病虫种类、发生程度，因地制宜确定主治对象，合理混配药剂，治“主”兼“次”，达到“一治多效”的效果。
对于稻飞虱的防治，一季稻7月初前不用化学农药，使稻田天敌建立强大的控害种群。同时抓好药剂防治，防治适期为卵孵盛期至低龄若虫高峰期。药剂要选用噻嗪酮、毒死蜱、锐劲特、敌敌畏等农药。虫态复杂的田块，宜选择两种对路药剂混用。在施药技术上要用足药量、对足水量（每亩60公斤）、喷准部位（稻株中、下部）、保持水层（寸深水层5天），无水田块加大用水量或用敌敌畏熏蒸，穗期防治宜采用手动喷雾器施药。各地在使用锐劲特时要注意避免对蟹、虾等水生动物造成危害。
对于稻纵卷叶螟的防治，水稻生长前期尽量不用或少用化学农药，充分发挥自然天敌控害作用。大发生年份，防治时期为卵孵高峰期，7天后再补治一次；中等发生年份，防治适期为低龄幼虫高峰期。在防治药剂的选用上，四（2）代防治可选用杀虫单（双）、Bt等药剂（选用生物农药Bt时，防治适期应掌握在卵孵高峰期），五（3）代防治可选用锐劲特、丙溴磷、毒死蜱等。
二化螟一代以早稻大田和一季稻秧田为重点保护对象，在卵孵高峰期选用Bt及其复配剂或在1、2龄幼虫高峰期选用杀虫单防治；二代重点防治单季稻田，防治适期在卵孵高峰期，重发区域7到10天后再补治一次，药剂选用锐劲特、阿维菌素复配剂；三代重点防治双季晚稻、迟熟一季稻，药剂选用三唑磷与杀虫单或阿维菌素复配剂。三化螟的一代结合防治二化螟兼治，二代挑治枯心。发蛾盛末期亩卵块密度120块以上的田块用药，药剂选用阿维菌素复配剂、杀虫单等，三代主治白穗。在中等发生稻区，掌握一季稻破口期（当5~10%%水稻破口露穗时）用药防治；重发稻区第一次用药在破口前3~4天，隔5~7天后再用药一次，药剂选用三唑磷与杀虫单或阿维菌素复配剂。防治过程中不同类型的农药要交替轮换使用，以延缓抗药性产生。施药时田间要尽量保持浅水层，对无水田块，必须加大用水量，确保防治效果。
对于稻瘟病的防治，农户要逐步淘汰感病品种，选用抗性优质品种。水稻品种在连续4~5年种植后要及时更换。水稻播种前用25%%咪鲜胺或5.5%%二硫氰基甲烷2500~3000倍液浸种。加强肥水管理。及时开展大田药剂防治。防治苗瘟、叶瘟，发现中心病株即挑治或病叶率达10%%时施药防治1~2次；防治穗瘟，老病区感病品种要严格做到破口前3~5天喷药预防，一周后再补治，药剂可选用75%%三环唑、40%%稻瘟灵等。
根据水稻条纹叶枯病粳糯稻重于籼稻的表现特性，提倡在上年偏重发生稻区压缩粳糯稻，扩种籼稻或推广种植盐稻8号、徐稻3号等抗病性较好的水稻品种。在小麦收割期秧田普治灰飞虱。选用毒死蜱加吡虫啉（如大功臣、蚜虱净）防治，重病区移栽前3~5天再补治一次。在病害常发区分别于灰飞虱第二、三代卵孵至低龄若虫盛期，每亩用毒死蜱（或混灭威）加锐劲特防治。
对于稻曲病的防治，农户可以选用抗病品种，如协优系列、D优527、秀水664等。还可以及时开展药剂防治。在水稻破口前7~10天第一次施药，破口期再补治一次。
