鳝苗放养应选择在晴天进行，放养水温以20～25℃为宜。可放养在原产地选用笼捕、诱捕等方法采集的天然苗种；也可放养从国家认定的原良（苗）种场购买的人工繁育苗种。
放养的苗种应经检验检疫合格，体质健壮无伤、无畸形，体色光亮，反应灵敏，粘液分泌正常，选择深黄大斑鳝或土红大斑鳝等优良种放养。
苗种应按规格大小分箱放养，一次性放足。商品鳝养殖苗种放养规格为20～50克/尾，每立方米水体放1.25～1.5公斤。鳝种培育放养规格为10～20克/尾，每立方米水体放养1～1.25公斤。
鳝苗放养前要消毒，消毒宜选择以下3种方法之一：①3%的食盐水溶液浸浴5～8分钟；②20～30毫克/升的聚维酮碘（含有效碘1%）溶液浸浴10～20分钟；③0.1～0.2毫克/升的四烷基季铵盐络合碘（季铵盐含量50%）溶液浸浴30～60分钟。
苗种消毒液水温与养殖水温相差不应超过3℃。
