僵苗
幼苗生长量少，展叶慢，新生叶叶色灰绿，叶片增厚，皱缩，组织僵硬；子叶和真叶变黄，地下部根发黄，甚至褐变，新生白根少。僵苗有别于由叶面肥和农药使用不当所产生的生长点停止生长，叶形变小，叶缘反卷，叶片变厚、皱缩扭曲的症状。
西瓜苗一旦发生僵苗，恢复得很慢，会延误有利的生长季节，严重影响产量和效益。僵苗是西瓜苗期主要的生理障碍。
发生原因：①苗床气温低，特别是土壤温度低，不能满足西瓜根系的基本温度要求。②育苗床土质粘重，土壤含水量高，在湿度大、通风不良的根区条件下发根困难，根的吸收能力差，定植后连续阴雨，僵苗发生尤其严重。③营养土配制不当。苗床或种植穴施用未经腐熟或未充分掺匀的有机肥而引起烧根或施用化肥过多，或化肥施于根部较近，土壤溶液浓度较高而伤根。④幼苗素质差。定植时苗龄过长，定植过程中根系损伤过多，或整地、定植时操作粗糙，根部架空、根与土壤没有紧密接触，影响发根。⑤地下害虫为害根部后根系严重受伤或死亡。
防治措施：①选择疏松、通气性良好的田园土或水稻田土作营养土，尽量不用土质粘重的河泥。②改善育苗环境，采用地热线或地膜覆盖育苗，提高地温，培育生长正常，根系发育好，苗龄适中，(自根苗30～35天，嫁接苗40～45天)。③苗床施用腐熟的有机肥，远离根部轻施复合肥，或喷施叶面肥，防止伤根。④适时适量浇水，以免降低苗床温度和地温，不利根系生长。⑤定植时采用高畦深沟，加强排水，适当增施穴肥(腐熟有机肥和化肥)，促进根系生长。⑥移栽前注意炼苗。⑦适时定植，防止定植后遭受低温的影响，选择冷尾暖头晴天定植。⑧防止蚂蚁和其它地下害虫。
徒长苗
西瓜苗生长过于旺盛，出现徒长，表现为节间伸长，叶柄和叶身变长，叶色淡绿，叶质较薄，组织柔嫩。
发生原因：西瓜苗床光照不足，温度过高，土壤和空气湿度高，嫁接西瓜育苗过程中，砧木、接穗在温、光、气控制不当时，易出现徒长苗。徒长苗对低温适应性差，容易发生冻害。
防治措施：合理调节光、温、湿。苗床温度采取分段管理，适时通风、降湿，增加光照，避免温度过高。降低夜温，加大昼夜温差。在光照不足的条件下，适当降低温度和湿度。
