石蛙卵呈球形，类似鱼眼，卵直径约2～3毫米，卵外层胶质，质膜呈圆形，卵产出落水后，胶质膜吸水即膨大，卵胶质膜彼此相连成卵块，呈葡萄状，卵块吸附在产卵池内的石块、水草或池壁上，未受精的卵3天后动物极明显变黄，植物极白色不透明。受精卵开始发育至蝌蚪孵出，整个孵化期是胚胎发育的时期，胚胎对外界变化十分敏感，这个时期要求环境生态条件稳定，避免阳光直射。人工捞取受精卵操作时必须仔细、轻缓，否则就会降低孵化率。在孵化过程中，水要清洁，水温15～30℃，pH值中性偏酸为宜，孵化密度每个孵化池一窝不可分开。
根据石蛙人工孵化试验观察，石蛙卵在产出后5～10分钟，动物极呈黑色，植物极呈白色，蛙卵在15～30℃水温下孵化，第五天可见受精卵动物极黑点变长呈线状，第七天胚胎呈条状，一端大、一端小、第八天胚胎明显显示头和尾、蝌蚪成形，并且会晃动。第十天就有少许蝌蚪孵化出膜，第十三天有76%孵出，第十五天全部孵出，孵化率达85.3%。如果孵化水温为25～29℃时，孵化时间只需8天，孵化率达85.3%。蛙卵在整个孵化过程中应做到温度适宜、水质无污染等技术要求，其孵化率就可达90%。
在繁殖季节，每天早晨巡池1次，母蛙排卵1小时后应将卵块取出，采卵时注意保持卵块的整体性，勿搞破、搞散、搞碎，取出的卵轻轻放于事先准备好的孵化池中进行孵化。孵化过程中除防止天敌侵害外，还应严格掌握孵化的生态条件，包括水温、水深、永质等要求，水温15～30℃，水深15～20厘米，pH值6～8，水质清新无污染，并含充足的氧气，光照自然即可，但忌阳光直射。温度是孵化的主要生态条件之一，它比起牛蛙的孵化温度来说低了些，高温对其孵化很不利。温度过高，会使胚胎发育到某个阶段停止，最后坏死，其中尤以发育到神经胚这一段时期死亡率最高，这是因这个时期胚胎正处于神经管的形成、脑的分化、原始消化管形成及胚层的初步分化时期，对外界不良环境反应特别敏感的缘故。
