近几年，我国用于食品加工的国产大豆以每年100万吨的速度递增，2010年的总量已经超过1000万吨，为总产量的65%。而目前，中国大豆蛋白已经占据国际贸易50%的份额，未来可能持续上涨。食品加工的巨额利润吸引着更多的食用油企业加入其中，这可能会引发原料短缺。
目前，中国大豆产业协会调查发现，国内企业都在设法开始大豆蛋白粉的项目。河北汇福粮油计划3年内把加工能力从200万吨增加到800万吨，其还自主研发了大豆卵磷脂，减肥食用豆油等新产品也即将面市。中纺也准备退出大豆蛋白加工项目，九三粮油也进入了大豆食品加工中。国产大豆蛋白加工已经成为了大豆加工工业发展的新趋势。
但是，中国国产的非转基因大豆产量近些年却未有明显提高，一直徘徊不前。若按目前大豆加工产业规模的发展，国产大豆将面临供应短缺问题。
中国大豆协会建议，确保国产大豆占30%的产业安全底线，建立非转基因大豆种植保护区，不要批准在国内种植转基因大豆。
