2006年我国农产品出口克服了国外技术壁垒影响和生产成本上涨压力，实现较快增长，全年出口310.3亿美元，同比增长14.1％。
水产品进出口总量633.7万吨，进出口总额136.6亿美元，其中出口量301.5万吨，出口额93.6亿美元，分别比上年增长17.4%和18.7%；进口量332.2万吨（扣除来进料加工原料163.7万吨和鱼粉97.7万吨，我国实际进口供居民食用的水产品70.6万吨），进口额43亿美元，分别比上年下降9.2%和增长4.4%。贸易顺差50.6亿美元，比上年增加16.3亿美元。水产品出口额占农产品出口总额的30.2%，继续位居大宗农产品出口首位。
2006年我农水产品出口呈现几个特点：①优势农产品出口快速增长，商品结构进一步优化，出口效益提高。②对日本市场出口放缓，对欧美市场增长较快，对西亚、拉美、俄罗斯等新兴市场增长迅速，出口增幅均在20%以上，出口市场进一步多元化。③民营企业成为出口新增长点，经营主体活力增强，形成了一批农产品出口龙头企业。
当前，我国农水产品出口形势仍不容乐观。一是日、欧、美加快食品安全立法，抬高进口门槛，技术壁垒从微观、技术层面向宏观、法律层面发展。二是主要发达国家在要求发展中国家开放农水产品市场的同时，无不对本国农业进行高额补贴。三是我国支持农水产品出口的政策体系同发达国家相比仍处于起步阶段，亟需进一步发展完善。四是农水产品出口呈现“小规模、大群体，小生产、大市场”的格局。农产品出口企业平均出口额仅为154万美元。出口企业普遍规模小，实力弱，行业协会组织化程度低，抵御风险和突破技术壁垒的能力差。五是农水产品加工程度低，深度加工品少，技术创新能力薄弱，在国外基本没有做宣传广告，名牌产品少，售价低，如烤鳗单价就比日本的低一半，每年损失达4亿美元。
