一、柑桔树脂病。病部皮层红色，干枯或略下凹，微有裂缝，但不立即剥落；病健交界处的皮层裂开，木质部裸露，现出四周隆起的疤痕。干枯型可转化为流胶型。无论哪种类型，病菌都能透过皮层侵害木质部。受害部变褐色，病健部交界处有一条黄褐色或黑褐色的痕带，导管阻塞，引起死亡。在多雨时病菌随雨点顺枝干流下或借风、昆虫等传播，从伤口侵入。受冻害的树体易发病并严重。
二、柑桔流胶病。发病皮层变褐色，水渍状，并开裂和流胶。病叶脉呈深黄色，易落。枝梢易干枯。花多，幼果早落，留下的果小而黄且酸。有时老病树能自然愈合，有的干燥翘裂，大量落叶，并在3～5年内枯死。高温多雨季节发病严重，日灼、虫伤能导致发病，流胶现象以冬季最盛。长期积水、土壤黏重或树冠郁闭等的桔园有利于该病发生。
三、柑桔脚腐病。又名裙腐病、烂蔸疤。以甜橙类发病严重。病菌主要侵染根颈处和黄熟果实。病部呈不规则水渍状，黄褐色至黑褐色，树皮腐烂，具酒糟气味，常流出褐色胶液。潮湿时病部发展迅速，干燥时病部则干枯开裂。有时扩展到根部，引起主根、侧根及须根大量腐烂，导致整株死亡。树冠上叶小而黄并脱落秃枝，病树多花，果实早落，果小而早黄味酸。病菌在病树主干基部或土中越冬，随雨水传播。
四、柑桔膏药病。主要发生在老树枝干上，或感染于叶片和果实。以菌丝体在病部组织越冬，春夏季温湿度适宜时，病菌借风、雨、昆虫传播。严重的病部长出黑褐色或灰白色绒状菌丝膜，紧贴于枝干上，如贴上膏药，表面光滑。膏药病有白色膏药病病原和褐色膏药病病原两种。
五、柑桔干枯病。病树树冠顶端叶片突然凋落，枝条相继枯萎、死亡。初期症状多出现在病树的一侧或一部分。严重时较大的枝条亦枯死，病树在2～3个月内死亡。病树带浅橙红色，树干的导管和形成层内常有黑色树胶。后期病枝表面长有很多黑色小粒点，病菌在枝梢上越冬，可通过带病苗木和嫁接材料传播。
防治上述病害，可采用下列措施：
1.加强管理，合理施肥。多施磷、钾肥；剪除病虫枝、死枝，并集中烧毁，促进通风透光度；做好防冻、防旱、防涝工作，种植豆科、藿香蓟等覆盖植物，以增强树势，提高树体抗病力。
2.枝干涂布药剂。刮净病部组织，纵切裂口数条，深达木质部，然后涂布以下药剂（任选一种）：843康复剂或 402抗菌剂50倍液；福美砷50倍液；8%～10%冰醋酸液；2%～3%腐植酸钠；50%多菌灵或70%甲基托布津100倍液：3～5度石硫合剂或高浓度的硫悬浮剂；25%瑞毒霉400倍液；多效霉素0.5千克＋水5千克～6千克＋2.4～D20毫克/升混合液；波尔多液：43%好力克1000倍液加多菌灵；30%禾益万克10倍液；沥青或新鲜牛粪加园土加毛发混合物。每7～10天施用1次，连续涂布，直至痊愈。
3.树冠喷药。冬季树冠喷洒松碱合剂8～10倍液，春季喷5波美度石硫合剂防治膏药病，也可用福美砷100倍液。防治脚腐病，先扒开根颈部泥土，用80%乙磷铝100～200倍液，或25%瑞毒霉400倍液喷洒。防治树脂病（河皮病），在发病前或新梢抽发和幼果时喷洒80%大生600倍液，或24%应得1000倍液，或25%丙环唑1000倍液，或 70%安泰生600倍液，或50%多菌灵或70%甲基托布津800倍液，或50%退菌特500倍液。
另外，用43%好力克4000倍液或20%猛克菌600倍液喷雾，预防枝干病害也有良好效果。用1千克石灰、50～100克食盐、4千克～5千克水配成涂白剂进行枝干刷白，对防止枝干病也有效。
