挑选符合贮藏标准的黄瓜，淘汰老熟的。过嫩的和有机械损伤的黄瓜，然后码放在消过毒（一般用0.1%漂白粉水溶液刷洗）的干燥筐中，每筐装总容量的3/4。夏季贮藏黄瓜，要选在凉棚中预冷，散去从田间带的余热。夏季如用8℃库温贮藏，需要使库温由高温逐渐降低到8℃，使黄瓜适应贮藏的温度，防止出“汗”。
黄瓜的表皮缺乏角质层，为了增加黄瓜的光泽，防止脱水和腐败菌的感染，入库前用0.2%的托布津与4倍水的虫胶混合溶液处理。方法是用软刷把混合液涂在黄瓜上，在阴棚中晾干，不要带浮水入库。
