天然的纳豆菌种从纳豆制品或从稻、谷中分离得到，这种方法得到的纳豆菌种中含有其他杂菌。1921年，半泽博士培养分离出纯纳豆菌种，使纳豆菌种商品化。
纳豆源于中国。纳豆类似中国的发酵豆、怪味豆。古书(和汉三才图会)记载有：“纳豆自中国秦汉以来开始制作。”纳豆初始于中国的豆豉。据《食品文化·新鲜市场》(石毛直道著，第101页)一书介绍，两种纳豆都与中国有缘。特别是咸纳豆，大约在奈良、平安时代由禅僧传入日本。日本也曾称纳豆为“豉”，平城京出土的木简中也有“豉”宇。与现代中国人食用的豆豉相同。由于豆豉在僧家寺院的纳所制造后放入瓮或桶中贮藏，所以日本人称其为“唐纳豆”或“咸纳豆”，日本将其作为营养食品和调味品，中国人把豆豉用锅炒后或蒸后作为调味料。
纳豆传入日本后，根据日本的风土发展了纳豆，如日本不用豆豉而用大酱，或用酱油不用豉汁。而且由于系禅僧从中国传播到日本寺庙，所以纳豆首先在寺庙得到发展。例如大龙寺纳豆、大德寺纳豆、一休纳豆、大福寺的滨名纳豆、悟真寺的八桥纳豆等，均成为地方上寺庙的有名特产。
日本人喜欢食用纳豆。他们主要食用咸纳豆与拉丝纳豆，关西人喜欢前者，关东人则爱吃后者。拉丝纳豆由于发酵方法不同，而出现一种黏丝，是不放盐的。
1921年半泽博士培养分离出了纯纳豆菌，使纳豆菌商品化了。
纳豆菌适应范围广，活力旺盛，繁殖力强，形成优势种群快，生命周期长。其繁殖能力是普通微生物的10倍，又极易存活，遇不良环境可形成芽孢产生高强度的保护作用抵制胃酸耐酸碱耐150℃高温。环境适宜时可迅速将孢子活化并蓬勃繁殖，形成优势菌群。经消化道排出体外后仍具有很强的活力。因此可以发挥集团化的快速“闪电战”作用，就象蝗灾、鼠灾一样耗光大量农作物等植物一样，添加纳豆菌能完全到达动物消化道通过快速耗氧繁殖消耗大量氧气避免有害细菌的滋生，同时能将大量动物未消化完全的大分子有机物转化成维生素、氨基酸、多种消化酶促生长因子等参与机体的生长代谢。
成份含量
纳豆菌及生物酶、维生素、微量元素等辅助剂，含菌量200亿/克。
纳豆激酶
纳豆激酶（nattokinase简称NK 纳豆激酶)是一种枯草杆菌蛋白激酶，是在纳豆发酵过程中由纳豆菌产生的一种丝氨酸蛋白酶。
功效应用
人的功效应用
溶解血栓，预防飞蚊症，预防高血压，降低胆固醇及预防粥状动脉硬化，抗菌消毒，调整肠道功能，降低体内酒精浓，减少骨质疏松的发生机会，抗癌效果，提高蛋白质的消化率，含有大量的Vit K2、Vit E、卵磷脂、亚麻酸等，故具有抗衰老、提高记忆力等保健功能。另外，常吃纳豆菌食品对癌症、糖尿病、高血压、动脉硬化、肥胖病、妇女病经等均有预防和缓解及治疗效果。
动物上功效应用
（a）1、纳豆菌适应范围广，活力旺盛，繁殖力强，形成优势种群快，生命周期长。通过快速耗氧繁殖（12分钟/代）消耗大量氧气形成优势菌群后避免有害细菌（18分钟/代）的滋生，增强以厌氧菌为优势菌群的肠道正常菌群的生长，调节肠道微生态平衡，提高免疫力，有效预防大肠杆菌等肠道疾病。
2、在快速繁殖过程中，产生大量多种维生素、氨基酸、蛋白酶（特别是碱性蛋白酶）、糖化酶、脂肪酶、淀粉酶，能降解植物性饲料中复杂的有机物，从而促进消化吸收，提高饲料利用率。
3、本品安全高效，无药残，无毒副作用，能减少抗生素药物的使用，增强免疫力。同时缓解动物不进食，生长缓慢等不良应激反应状态，恢复由于用药造成的动物体质下降，提高疫苗抗体水平等综合抗病力。
4、本品对特殊菌体进行促芽孢和微胶囊包被处理，因而能耐酸碱、耐氧化、耐高温(150°C)、耐挤压，在高温制粒和酸性胃环境中均能保持活性，可以耐唾液和胆汁的攻击，是饲料微生物中可直达大小肠的活菌，更能促进动物对饲料的消化吸收，提高生长速度。
5、除臭驱蝇，减少污染，控制细菌性疾病，能减少粪便中氮、磷、钙的排泄量，减少粪便臭味及有害气体排放，表现为动物粪便臭味逐步减轻，减少饲料蛋白质分解为氨气浪费，从而减少环境污染。
6、改善肉蛋奶品质，生产“绿色肉”、“农家蛋”、“无抗奶”，本品通过增强消化吸收功能，充分吸收利用饲料中营养成份及原料的天然色素，无需添加化学色素苏丹红、加丽素红造成对人体的有害物质及影响畜禽产品天然食用风味，可媲美家养畜禽肉。能天然增加动物产品着色度和食用风味，猪只皮肤红润，毛色发亮；肉鸡肉鸭颜色加深；改善蛋壳质量和颜色，蛋清厚稠，蛋黄鲜红；水产动物颜色更加健康，无斑点。
7、 本品添加于发酵豆粕、发酵饲料中，有利于平衡微生物营养需求，促进微生物的生长繁殖，发酵更快更好更透彻。
(b) 用法用量
1、饲料添加
按全价饲料添加本品计算：乳猪：200-250克/吨 仔猪、生长猪、育肥猪：100-200克/吨 种蛋禽：150-200克/吨
肉禽：100-200克/吨 反刍：500-1000克/吨 水产：200-250克 发酵豆粕、发酵饲料：50-100克/吨
2、饮水
按250-500倍稀释自由饮水。
保健效果
1、晚餐吃纳豆效果最好。通过实验，专家认为：食用纳豆1小时至12小时之间纳豆激酶发挥溶解血栓的功能。而据统计脑梗塞、心肌梗塞等各种血栓病，发病时间多为清晨及星期一。因此每晚或星期日晚餐吃效果最好。
2、尽可能不加热吃。纳豆激酶不耐热，加热到70℃活性就消失了。所以生吃效果最好。
3、必须坚持每天吃。纳豆激酶进入体内后，其活性维持12小时。所以尽可能每天吃30-100g最理想。
4、保质期稍过也能吃。纳豆的保质期为一周，它在冰箱内低温保存过程中，还在进行着缓慢的低温熟成发酵，
