五味子栽培中常见的病害为根腐病、叶枯病、白粉病等。在病害防治中使用药剂时，必须选用经过农业部药检所正规登记、国家允许使用的农药品种，以防农药药害对五味子生长的不良影响及高毒农药的残留危害。
一、根腐病
症状：该病一般5-8月发病。开始发病时根部与地面交界处表皮变黑，进一步皮层腐烂、脱落，形成环状，叶片萎蔫，几天后整株死亡。
发病原因：发病原因较为复杂。早春、晚秋地面昼夜变化剧烈、温差大，处于根茎部位的组织柔嫩，抗病力低，皮层受冻感染菌类，或根茎处受到机械损伤等均会腐烂发病。涝洼积水地、较粘重土壤发病重，发育不健壮、枝蔓成熟度差的植株发病重。
防治方法：⑴选择高燥、不低洼的壤土、沙壤土地块栽培五味子。⑵加强田间管理，平衡施肥，增强树势，雨季注意排水。秋季上冻前根部培土或覆盖秸秆，防止根茎部位受冻害，同时预防早春冻拔现象。⑶生产作业时少伤根和植株。⑷发病初期选用50%多菌灵WP500倍液、或77%多宁WP500倍液等灌根，发病初期连续用药2-3次，间隔7-10天。
二、叶枯病
症状：每年5月下旬至7月上旬发病，发病时先由叶片的叶尖或边缘干枯，然后逐步扩大到整个叶面，叶子干枯而脱落，随之果实萎缩，造成早期落果现象。
发病原因：空气潮湿，雨水偏大的条件易于发生，在果园肥料不足或偏施氮肥、地势低洼、架面郁闭时发病比较严重。落叶后或萌芽前彻底清理病枝病叶，烧毁或深埋，减少越冬病原菌密度。萌芽前全园喷施1次5波美度石硫合剂。在管理上，注意枝蔓的合理分布，避免架面郁闭，增强通风透光。
三、白粉病
症状：一般先从幼叶开始侵染，叶背面出现针刺状的斑点，逐渐上覆盖白粉，严重的扩展到整个叶片。病叶由绿变黄，向上卷曲，枯萎而脱落。幼叶发病先是靠近穗轴逐渐扩展到整个果穗，病果出现萎蔫、脱落，在果梗和新梢上出现黑褐色斑点。
发病条件：病菌孢子在4-7℃时即可萌发，萌发的最适宜温度为25-28℃。在高温干旱条件下有利于发病，一般，发病初期在5月下旬至6月初，6月下旬达到发病盛期，从植株发病情况看，枝蔓过密、徒长、氮肥施得过多和通风不良的环境条件有利于此病的发生。
防治方法：发病初期喷洒25%粉锈宁WP2000倍液，45%达科宁WP800-1000倍液，47%加瑞农WP800倍液，70%甲基托布津WP1000倍液等，每7-10天喷洒1次，共2-3次。
