口腔溃疡常会由消化系统疾病和功能紊乱，如腹胀、腹泻或便秘等情况而发生。
内分泌变化。往往发生在女性月经期，与排卵后女性体内雌激素量下降有关。
精神因素。有的人在精神紧张、情绪波动、睡眠状况不佳的情况下发生，与自主神经功能失调有关。
遗传因素。父母双方有复发性口腔溃疡时，子女有80%～90% 遗传，双亲之一如果患此病，子女有50%～60%会遗传。
其他因素。如缺乏微量元素锌、铁、叶酸、维生素B12等，会降低身体免疫功能，增加复发性口腔溃疡病的可能性。
