食用菌是漳州农业八大优势特色产业之一，为进一步做大做强食用菌产业，漳州市深入实施“科技强菌”战略，抓好杏鲍菇废菌渣栽培蘑菇生产基地建设工作，开展“食用菌新品种选育及安全生产技术研究与示范”—安全生产示范基地建设，大面积推广标准化、工厂化、规模化和绿色生态种植管理模式，调整生产布局，优化产品结构，突出区域特色，强化菌政管理和市场信息服务，抓科技、重培训，加大产业指导力度，引导发展循环经济，食用菌产业链条得到迅速延伸，经济效益、环境效益和生态效益实现同步提升。
现拥有蘑菇、白背毛木耳、大杯蕈、秀珍菇、棕色蘑菇、杏鲍菇、金福菇、草菇等20多个品种。据农业部门初步统计，2011年漳州全市食用菌生产总量（鲜品）32.67万吨，产值17.31亿元，分别比增4.75%、4.53%。其中蘑菇栽培面积1250万平方米、产量15万吨、产值7.5亿元，白背毛木耳1.6亿袋、产量11.30万吨、产值3.34亿元，珍稀菌类产量6.73万吨、产值6.47亿元。重点培育发展了一批辐射带动能力强、产业利益连结紧密的龙头企业，带动了加工及营销业的发展，全市现有盐水菇、脱水菇加工企业210家、罐头企业52家、速冻企业26家，种植、加工、营销一体化企业30多家，食用菌机械厂3家，漳州蘑菇罐头的出口量占全国的80%左右，年出口量22万吨左右，已在漳州形成一个从业人员达20多万人的优质绿色产业集群。
