农业专家上书中央
最早动了直接给中央写信的念头，是在2008年10月份的甘肃酒泉，当时，中国农科院的退休专家佟屏亚，正在参加一个种业论坛。大家说，良种补贴的问题太严重了，应该联名给温总理写封信，反映实际情况。
在这之前的2008年5月，河北省徐水县已经有250多名农民联名给中央写了信，因为当地良种补贴的种子导致了小麦严重减产。
佟屏亚最早听说良种补贴中存在问题是在2004年的冬天，当时，一个大公司老总对他说，“良种补贴的事情，你听说没有？”当时良种补贴的规模并不大。2002年，国家财政拿出1亿元，补贴大豆1000万亩。2003年，良种补贴资金才开始在小麦种植区试点。
2005年，佟屏亚利用整整一年的各地讲课机会，把这个良种补贴的事情了解清楚了，结果“令他震惊”。2006年2月份，佟屏亚把这次调研情况写成了一篇《良种补贴如何把好事办成好事》的文章，发表在种子业界几份知名的杂志上。之后，佟屏亚又把这些调研内容提炼出要点，写信寄给了国务院。
他告诉《投资者报》记者，这封信后由国务院政策研究室接手，有关领导做了批示，据说措辞非常严厉，其中有这样的表述：搞成这个样，出现这些事情，是对人民的犯罪。
这两篇文章在农业部立刻引起了轩然大波，正在大连讲课的佟屏亚忽然接到中国农科院的电话，要其迅速回京。
当时，农业部派了种植业司、财务司等部门的三位司级官员、两位处长来见佟屏亚，表示说，农业部收到了国务院的批示，已经调研了河南、山东和江苏三个省，来落实佟屏亚两篇文章中提到的问题。
农业部的人很客气，拿出了四条改进意见，请佟屏亚“帮助我们完善良种补贴”，但佟屏亚只坚持一条，“把良种补贴直接发给农民”。当时农业部的财务司负责人很不高兴，“我就批评了这位负责人。”佟屏亚说。
“我们去完善”，农业部方面最后表示，这场见面不欢而散。其后，农业部确实将良种补贴政策做了部分的改善，佟屏亚也由此感受到了给高层写信的效用。
在给温家宝的信中，佟屏亚写到，农业部以“项目”实施良种补贴操作方式，层层设卡，招标采购，成绩不大，弊端很多。概括起来有5句话：搭建了层层索贿的平台，统一供种干预种子市场的正常运行，基层农业局重新成为最大的垄断经销商，剥夺了农民用种的自主权和知情权，还可能导致种子企业濒临破产。
“其结果是农民得不到国家扶民政策的实惠，最终造成粮食减产并影响到粮食安全。广大农民和种子企业反映强烈，今年以来在安徽、山东、河北许多省市频发群访事件，要求国务院把良种补贴款直接发到农民手中”。
