新疆渔业发展迅速，2008年水产品产量达到9.4万吨，继续稳居西北地区首位。
天山、阿尔泰山、昆仑山等高山孕育的众多河流与湖泊是新疆发展渔业的良好条件。目前，新疆渔业养殖品种不断优化，团头鲂、虹鳟、加州鲈、南美对白虾等品种已具养殖规模；白斑狗鱼、东方欧鳊、河鲈等品种的人工繁育技术取得突破性进展；天然水域渔业资源开发利用力度逐年增加。同时，无公害水产品及产地的认证认定工作也有力开展，博斯腾湖、赛里木湖、乌伦古湖三大天然水域均通过国家有机食品生产基地认定，16个产地、33个品种通过无公害初步认定。
在渔业快速发展的同时，水产品加工也逐步推进，并大量出口国外。2008年，全区渔业经济总产值达到11亿元，渔业人均收入7500元，远远高出全疆农民人均收入。2009年我区力争水产品产量达到10万吨，渔民人均纯收入达到8000元。
自治区水产局总工程师叶尚明：“以科技推广为支撑，推进渔业产业化发展。预计到2015年我区渔业总产量达到15万吨，渔业经济总产值达到20亿元。”
