重庆奶业目前存在的问题很多，阻碍了奶业发展，其主要问题是：基地布局不合理，不利于基地良性发展；饲养分散，管理水平不高；规模增长较慢，品种老化现象突出。随着重庆经济的发展，市民生活水平的快速提升，以及健康意识的不断加强，２００５年，全市城乡居民人均消费奶制品达到８．３公斤，其中城镇居民人均消费３２．３公斤。今后重庆奶业仍将在困难的条件下逐步发展，要推动重庆奶业的不断发展，必须解决目前奶业发展中的问题，该市将通过有效措施促进奶业快速发展。
调整产业布局。过去重庆市的奶业是典型的城郊奶业经济，基地主要集中于主城的江北区、渝北区、南岸区和沙坪坝区，近几年随着城市圈的不断扩张，粮食生产布局的调整，饲草料供给和地方经济的制约对部分奶牛养殖基地造成了很大的影响，部分奶农转移至城市务工，同时，部分奶牛流失。因此，该市奶牛养殖基地将有计划地从近郊向低成本的三峡库区带和东、南山区带转移，为实现奶牛的饲养与牧草种植有效结合、协调发展做好了准备。
推进奶业标准化生产。饲养分散、管理水平不高也是制约奶业发展的要素之一。该市将从根本上改变该市分散饲养的落后饲养模式，建设高标准的奶牛饲养小区，实行科学的饲养管理，推广机械化的挤奶方法，从根本上提高重庆奶源的卫生状况，不断提升奶农的标准化生产意识，对其进行科学饲养专业技术培训和现场技术服务指导。
