为确保香港同胞吃上“放心食品”，广东严把检验检疫关。目前内地供港鲜活商品约７０％是经广东检验检疫的，每天有４００多辆货柜车源源不断运往香港。
面对近年来国内外频繁发生的动植物疫情疫病和食品安全事故，广东检验检疫部门以加强源头控制为重点，大力推行供港食品电子检验检疫监管。目前已有１００多家出口食品企业实施了视频和数据电子化监控。从２００１年初开始，针对禽流感事件，广东检验检疫部门引入电子监管新模式，对供港家禽实现了“种苗—饲料—免疫用药—检验—出口监装”的全过程监管，从源头确保供港家禽的安全卫生质量。
针对前段时间香港出现的水产品检出孔雀石绿事件，广东检验检疫部门严格执行供港水产品药残检测制度，加强了安全卫生监控和检测措施，目前市面上没有发现经过检验检疫的供港澳水产品有孔雀石绿等问题。
此外，广东还建立了供港食品风险预警及快速反应机制以及食品突发安全卫生事件处理预案，提高应对食品突发事件的能力。针对“毒菜”问题，广东检验检疫部门对供港蔬菜严格把关，实行菜场、收购站考核年审制度，辖区内供港蔬菜已经连续９年未出现毒菜事件。
今年四川发生人感染猪链球菌病事件，为确保广东辖区内供港活猪安全、卫生，广东检验检疫局加强了对供港活猪的检验检疫，特别是加强出口前的临床检查，至今在注册猪场没有发现猪链球菌病例。
与此同时，广东检验检疫部门与香港食环署、渔农署、卫生福利署等有关部门建立了良好的合作机制，如粤港食物安全控制例会制度、联络员制度、部门之间互访等制度。香港食物环境卫生署和渔农署根据需要派员赴广东供港注册农场进行探访，双方的实验室定期进行检验方法的比对和交流学习，特别是在禽流感、口蹄疫、猪链球菌、乙类兴奋剂、苏丹红一号和孔雀石绿等检测等方面都进行了充分合作。
