目前，随着人们生活水平的提高，特别是在生态破坏和环境污染日益严重的情况下，安全、卫生、健康的食品将成为人们消费的主流。
误区一：化肥成为污染的代名词。
多年的生产实践认为化肥的使用是必要的。化肥在农业增产中所占的比例达40％以上，如果全世界停止使用化肥，全世界粮食将减少15—65％。事实上，生产无机氮肥和钾肥的原料比较单一，杂质少；且氮肥和钾肥都是比较纯净的化合物晶体，一般不含有重金属，导致污染的可能性不大。但磷肥的原料磷矿石较复杂，多含有较高的重金属成分，且在制造过程中的酸化工艺使重金属活性大大提高，尤其是镉含量较高，须引起重视。
误区二：有机、绿色、无公害食品生产中，禁止使用化肥、农药。
生产绿色、无公害食品可以施用低残留农药、化肥和其他化学制品，前提是不能对环境和作物质量产生不良后果，作物产品中有害物质残留和积累需控制在影响人体健康的限度内。
误区三：有机肥是天然肥料，是无污染的。
有机肥比无机肥的问题更多，也更严重。有机肥，特别是畜禽粪肥、垃圾堆肥和污泥堆肥的成分比较复杂，除了含有病原微生物外，还可能含有石油污染物、农药、激素、盐分、重金属等。有机肥产品重金属含量较高，长期使用有机肥有可能导致土壤重金属污染，并进入食物链威胁人畜的健康。土壤中的有机毒物主要是通过农药及残留有机肥带入，有机肥必须发酵腐熟，否则危害更大。
误区四：禁止使用化肥农药就是生态农业、有机农业。
土壤主要污染来源来自灌溉水、固体废弃物、大气沉降，以及农药和化肥的不恰当投入等。未经处理的污水、生活垃圾、畜禽粪便及含重金属镉、铅较高的磷矿粉等长期使用，化肥施用不当或超量施用等都将造成土壤有害物质积累和养分失调，并对作物直接造成危害。生态农业、有机农业生产仅靠禁止化肥、农药是不够的，必须全程把好肥料、灌溉水、大气质量这三大关。
