随着套袋苹果数量的增加，果面上发生黑点病及红点病也比较普遍。黑点病发病初期，果实`萼洼周围出现针状小黑点，黑点直径逐渐扩大，有的如芝麻大，有的如绿豆大，还有的在黑点上带有一小白点。病斑只发生在果实表皮，不会引起果肉溃烂。红点病多发生在苹果摘袋后，若遇雨，多在向阳果面上形成许多针状小红点。
一、粉红聚端孢霉菌、镰孢霉菌侵染果面引发黑点病
这些病菌也是苹果霉心病的致病菌，属半知菌亚门的弱寄生菌，与斑点落叶病病菌属一类，一般不侵染果面，但套袋后果实处在湿度大、透气差、温度高的环境下，易引起病菌侵染发病形成小黑点。而且越是连阴天气、地势低洼、高温高湿、树势较旺、树冠郁闭、施氮肥过多的套袋果园越容易发病。所以防治黑点病，除改善果园风光等条件外，将病菌在苹果套袋前杀灭是关键的药剂防治措施。防治效果较好的药剂是：80%喷克800倍，1.5%多抗霉素400倍，绿菌灵800倍等。
二、康氏粉蚧危害造成黑点病
康氏粉蚧为害套袋果引发的黑点病多集中在萼洼和梗洼处，萼洼部位尤为严重。套袋后康氏粉蚧多聚集在萼洼处刺吸果实汁液，造成小黑点，而且多覆有白色蜡粉。所以，套袋前喷药杀灭康氏粉蚧，是防治黑点病的有效措施。有效药剂有：20%丰收保可湿性粉剂1500倍，50%保丰灵可湿性粉剂2000倍，99.1%敌死虫乳油400倍。
三、乳油类或颗粒粗、悬浮率差的药剂等在套袋前使用引发或加重黑点病
苹果谢花后到套袋前，幼果绒毛刚脱落不久，皮孔敞开尚未愈合，幼果果园对外界刺激非常敏感。若使用乳油类或颗粒粗、悬浮率差的刺激性强的杀菌剂、杀虫剂或杀螨剂，都会刺激引起皮孔细胞死亡堵塞而发生黑点病。所以谢花后到套袋前提倡使用粉剂或水剂型杀菌、杀虫和杀螨剂，而且颗粒要细，悬浮率要好。
四、缺钙、缺硼能引发黑点病
经试验和化验分析，缺钙、缺硼在套袋苹果果面上容易引起形似苦痘病斑大小的黑点病。套袋苹果易缺钙和硼。所以在苹果套袋前多次通过叶片喷施钙和硼，能有效减轻黑点病的发生。经试验，套袋前喷用3~4次果硼钙或苦痘钙800倍，能达到钙硼双补的效果，减轻黑点病的发生。
五、斑点落叶病菌侵染果面造成红点病
斑点落叶病在不套袋果上只侵染叶片造成叶斑，但在套袋苹果上不但为害叶片，而且还侵染幼果果面及刚摘袋幼嫩的果面，在果面上造成针状红点病。所以对红点病的防治一要抓好套袋前对斑点落叶病的防治，二要抓好摘袋前后对斑点落叶病的防治，防治斑点落叶病的有效药剂有：1.5%多抗霉素400倍或10%宝丽安1000倍，80%喷克800倍。
