收获嫩藕时，首先要确定藕的生长位置与方向。藕的方位在后把叶和终止叶直线的前方。后把叶是终止叶前面的一片叶子，也是下降阶梯的最大、最后的一片叶子。终止叶俗称“花吊”，终止叶的特点是叶片卷而不开展，叶背微红色，叶柄刺少，叶中心长叶柄处的叶蒂头特别红。有时因地下莲鞭纵横交错，找不到哪是后把叶和终止叶连成直线时，可把这两片荷叶摘除，把一根叶柄浸入水中，用嘴对另一根叶柄通气孔吹气，如果浸入水中的叶柄有气泡冒出来，说明这两片叶是相通的，生长在同一根地下茎上，它们的下面就是藕的位置。
嫩藕的收获。一般都在水中进行，收获时用手扒泥，将藕身附近的泥扒开，然后沿着后把叶的叶片向下，折断莲鞭，慢慢将整藕向后拖出。深水荡藕，不能用手挖藕，可用脚探到藕的位置，同时用手持着后把叶的叶柄，用脚挖去藕旁之泥，继之，在藕的后方踩断莲鞭，最后持藕节将藕身提出，以防折断。如水太深，可用藕钩钩住藕节，慢慢将其拉出水面。
嫩藕质脆，容易折断，收获时要特别小心。有的地方收获嫩藕时，只挖主藕，留下子藕，到翌年4月上旬前收老藕。有的留下子藕作翌年的种藕。嫩藕采收前一天或数天，将荷叶在叶蒂处摘去，只留后把叶和终止叶，以作采收时的标记。这时叶片青绿，晒干后可做包装材料，1000平方米可采收干荷叶80～90千克。这时摘去叶片，对地下茎发育没有多大影响，使地下部分停止呼吸，促使藕身上附着的锈斑还原，提高莲藕的质量。
嫩藕的产量，因栽培地区、条件、品种不同，相差较大。一般每公顷产10～20吨。早熟品种及早收获的产量较低，晚熟品种和晚收获的产量较高。同时，田藕的产量往往比荡藕的产量要高一些。通常来说，栽植后的第一、第二年的产量较低，第三、第四年产量最高，到第五、第六年，产量趋于下降，这时要及时轮作换茬。
莲子成熟时，莲蓬呈青褐色，莲房孔开始张开，莲子果皮呈茶褐色。伏子因烈日暴晒，莲蓬易发黑，应在变黑色时才可收获，秋子只要稍带黑色就可收获。收获莲子必须及时，过嫩莲子不充实，晒后干瘪，过老风吹容易脱落。
子莲的产量，一般每公顷可收壳莲700～1000千克，高产可达1500千克。它也和藕莲一样，第一、第二年产量不高，第三、第四年产量最高，第五年开始产量下降。
