香葱在夏秋高温高湿的多雨季节，极易暴发流行性香葱疫病，可使原本绿油油的香葱在2―3天内变得黄斑累累，继而变白，葱叶垂蔫，甚至腐烂，造成严重损失。
香葱疫病主要危害葱叶和花梗。葱叶染病初期出现青白不明显的斑点，扩大后成为灰白色斑，沿葱叶纵向蔓延，很快成为长形白斑，宽度超过葱管周长一半，甚至更大；造成葱叶下垂、枯萎；阴雨连绵或湿度大时，病部长出白色棉毛状霉；天气干燥时白毛消失，但撕开病叶仍可见葱管叶内侧有棉毛状的白色菌丝体。
该病由一种称烟草疫霉的真菌引起，是致病力很强的恶性传染病害，病菌以孢子或菌丝体在病残体内越冬，温暖的冬季里病菌可以周年浸染，苗种的葱头也可以带有病菌，病菌孢子可借风雨和气流传播，孢子萌发后产生芽管，穿透葱叶表皮直接侵入寄主，高温高湿条件下很快造成香葱发病，并在病斑产生孢子迅速传染，扩大危害，25℃―32℃最适合发病。高温高湿阴雨连绵，该病最易流行；种植密度大，地势低洼田间积水都利于发病；施用化肥过多，氮肥偏重，植株软弱时发病更重。
防治香葱疫病首先要求种植地排水良好，高畦深沟整地，雨水及时排水降低田间湿度；彻底清除田间病残株和实行与非葱蒜类蔬菜轮作，采用合理配方施肥，增加磷钾肥和微量元素肥，避免偏施氮肥。施用草木灰也有利于提高抗病力。一旦发现疫情出现必须立即抓紧时间，选用如下药剂喷洒防治：霜尽（60％烯酰吗啉锰锌可湿性粉）800―1000倍、天克锰锌（60％可湿性粉）700―800倍、霜露速净（72％可湿性粉）1000―1200倍、卡霉通（64％可湿性粉）700―800倍、瑞毒霉（58％可湿性粉）500―600倍，最好每7天喷一次，连续2―3次。另外，百可宁（40％悬浮剂）、乙膦铝锰锌（70％可湿性粉）、佳达宁等药剂对该病都有较好的防治效果。
