一、辣椒病毒病
1.种子处理。将干种子置于70℃恒温干热条件下处理72小时钝化病毒；或用清水浸种3～4小时，再放入10%的磷酸三钠溶液中浸泡40～50分钟，洗净、催芽后播种；或用0.1%高锰酸钾浸种30分钟后，再洗净催芽。
2.在整枝打杈时先接触健株，后接触病株，以减少接触传染的机会，手要用肥皂液洗净。在分苗、定植前，或花期分别喷洒0.1%～0.2%硫酸锌。利用保护地设施，于终霜前20～25天定植，或采用塑料膜覆盖栽培。
3.做好蚜虫的防治，尤其是苗期。当田间发生蚜虫时，可使用10%吡虫啉可湿性粉剂3000倍液，或5%高效氯氰菊酯乳油1500倍液等防治。
4.在定植前后各喷一遍83增抗剂100倍液。
5.发病初期可喷洒20%病毒A可湿性粉剂500倍液，或1.5%植病灵乳剂1000倍液，或抗毒剂1号200～300倍液，间隔10天连喷3～4次，如果在上述药液中加入喷施宝5000倍液、爱多收6000倍液等防治病毒病的效果会更好，有条件的还可用弱毒疫苗N14加S52喷洒。
二、辣椒疫病
1.选用早熟避病或抗病品种，种子消毒可先把种子用52℃温水浸种30分钟或清水预浸10～12小时后，用1%硫酸铜液浸种5分钟，捞出后拌少量草木灰，也可用种子重量0.3%的72.2%普力克水剂或0.3%的69%安克锰锌可湿性粉剂拌种。
2.实行轮作，避免重茬，加强栽培管理，实行无病新土育苗，合理施肥、浇水，提倡垄作覆膜栽培，加强通风透光。
3.发现病株及时拔除，并用药剂处理病穴。可使用1%硫酸铜溶液或50%甲霜铜可湿性粉剂500倍液等。
4.定植时土壤消毒，每亩用50%甲霜铜可湿性粉剂400～500克，与细土混匀施入定植穴内；在青椒缓苗成活后，用72.2%普力克水剂或64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液灌根，每株浇250毫升药液，间隔10～15天灌一次，连灌2～3次进行预防。
当田间植株出现发病中心后，可用烟薰法或粉尘法，在发病初期使用45%百菌清烟剂，每亩每次用250克，也可在发病初期喷施58%瑞毒霉锰锌可湿性粉剂600倍液，或64%杀毒矾可湿性粉剂600倍液，或72%杜邦克露可湿性粉剂600～800倍液，或50%甲霜铜可湿性粉剂800倍液，或72.2%普力克水剂600～800倍液，7～10天用药一次，连喷2～3次。
三、辣椒灰霉病
1.加强棚室通风管理。提高棚温，降低棚内湿度，减少或避免叶面结露。发病初减少浇水，坐果后及时摘去花瓣，摘除病枝、病果、病叶。
2.棚室定植前，用6.5%甲霉灵粉剂1千克/亩喷粉，或50%多霉灵可湿性粉剂600倍液、或50%利得可湿性粉剂1000倍液喷洒，对棚膜、地面、墙面进行表面灭菌。
发病初期可选用10%速克灵烟剂每亩每次250～300克熏棚，也可喷洒5%百菌清粉尘剂，10%灭克粉尘剂每亩每次1千克，还可以选用50%扑海因可湿性粉剂1500倍液，或50%速克灵可湿性粉剂1000倍液，或60%多菌灵超微粉500倍液，或70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，或50%乙烯菌核利水剂600倍液等，间隔7～10天一次，连续防治3～4次。
四、辣椒炭疽病
1.种植抗病品种，从无病株上留种，或对种子进行灭菌处理，将种子放在55℃温水中浸10分钟，然后在冷水中冷却，晾干后催芽播种。药液浸种：先将种子在冷水中浸10～12小时，再用1%硫酸铜溶液浸5分钟，或用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液浸种1小时，捞出后用清水冲洗干净催芽后播种。
2.发病严重地块与瓜、豆类蔬菜轮作2～3年，采用营养钵育苗，合理施肥，增施磷钾肥，合理密植，加强棚室管理，通风透气，降低棚内温度，促使植株健壮，清除病残老叶。
3.发病初期摘除病果并喷药防治，可选用45%百菌清烟剂，每亩每次250～300克，或5%百菌清粉尘剂每亩每次1千克。也可以喷洒70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂800倍液，或80%新万生可湿性粉剂800倍液，或77%可杀得微粒粉700倍液，或48%铜高尚悬浮剂600倍液等。间隔7～10天一次，连续防治2～3次。
