洋葱育苗中的主要虫害是地下害虫，如蟒蜡、缕姑、小地老虎，蛆躬｝、老鼠也常发生危害，另外还有蚜虫、蓟马等。
(1)蛴螬 蛴螬为金龟子的幼虫，俗称“地蚕”。咬食萌芽的种子，或直接咬断秧苗的根和茎，断口整齐，一般当表土10厘米处的地温在51c以上时傍晚开始上升到土表活动，13-18℃时活动最猖獗，25℃以上则往深土中移动。在早春育苗和土壤潮湿时活动性强，为害严重。防治方法：
第一，配制床土时发现害虫及时拣出。
第二，营养土要用腐熟的有机肥，并经长期堆制。床土不要过湿，并防止成虫混人。
第三，可用80％敌敌畏乳剂1200一1500倍液结合浇水用米乐尔每平方米8一10克撒于床上。
(2) 蝼蛄喜欢在温暖潮湿的土壤中生活。蝼蛄经过的地方常常在平整的床面上隆起一条条纵横弯曲的隧道，使幼苗根系与床土分离，幼苗易失水而萎蔫甚至死亡。蝼蛄的成虫和若虫在苗床中还咬食种子或咬断幼苗根部，根茎，使幼苗死亡。蝼蛄的活动特点是昼伏夜出，以夜间9-11时活动最盛。防治方法与防治蛴螬相同。同时由于蝼蛄能在床土表面活动，也可用毒饵诱杀。取糠、麦皮、玉米等在锅里炒香，加人90％敌百虫300一 500倍液拌匀做成毒饵，撒在苗床周围或蝼蛄经常活动出入处诱杀。
(3)小地老虎主要以幼虫为害秧苗03龄以前的幼虫昼夜吃食秧苗的嫩叶和心叶，3龄以后，白天潜伏在表土中，夜间出来为害，尤其是清晨为害最凶。幼虫将秧苗近地面的茎咬断，使秧苗死亡。小地老虎喜欢温暖潮湿环境，在气温10-16℃，相对湿度90％以上时活动最旺盛，该虫有较强的趋化性和较弱的趋光性。防治方法：
第一，诱杀成虫。把用糖醋液（糖醋各3份，加人适量敌百虫）或黑光灯诱杀。
第二，诱杀幼虫。把鲜菜叶浸入90％敌百虫400-500倍液中10分钟，于傍晚撒在田间诱杀，或用鲜嫩叶、草小堆诱集清晨在堆下捕捉。
第三，药剂防治。同蟒蜡。
(4)蛆洲蛆躬｝在土中活动，使刚发芽的种子及幼苗的根与土壤脱开，以致失水干枯死亡。蛆蜕忌水，喜在有机质多的土壤和有机肥料中活动取食。其防治方法为：
第一，苗床地采用水旱轮作，杜绝苗床地内的蛆躬！。
第二，营养土经长期堆制，并在使用前过筛。
第三，床土消毒（方法同蟒赠）。
(5)蚜虫常常密集在秧苗幼嫩叶片的背后或心叶吸食汁液，使叶片皱缩，卷曲，秧苗生长停滞，严重时秧苗萎蔫，甚至死亡。蚜虫还能传播病毒病而造成更大的危害。通风不良，温暖干燥的地方蚜虫为害严重。由于蚜虫除了自身危害秧苗外，还能传布病毒病，所以对蚜虫的防治应引起重视。苗床内一般用药剂防治，常用药剂有：50％辟蚜雾（抗蚜威）2 000一3 000倍液，10％多来宝1 500一2000倍液，或20％蚜克星1 000倍液，或25％菊乐合醋2 500倍液，3%莫比朗1 000-1 500倍液，10%毗虫琳（康福多、蚜虱净、大功臣、一遍净）3 000一4 000倍液，10％氯氰菊醋（兴棉宝、灭百可）乳油2 000一4 000倍液，2．5％嗅氰菊醋（敌杀死）乳油3 000倍液，20％灭扫利（甲氰菊酷）乳油2 000倍液，50％马拉松乳油1 000一1 500倍液。
⑹蓟马在育苗期间蓟马主要为害洋葱，成虫和若虫锉吸嫩梢、嫩叶，影响秧苗生长。蓟马几乎能周年发生，所以在防治上，首先应严格堆制营养土，并严格消毒；其次，苗床地的选择尽量不采用上年（或前茬）为洋葱类的田块；第三，用药剂防治，如5%锐劲特3 000倍液，20％好年冬2 000倍液，1％杀虫素3 000一4 000倍液。
