腺鼠疫潜伏期多为 2-8天，原发性肺鼠疫及败血症型鼠疫潜伏期为数小时至3天，曾接受预防接种者，可长达 9-12 天。起病急骤，有畏寒、发热及全身毒血症症状，可有呕吐、腹泻及身体各部位出血，亦可有呼吸急促、发绀、血压下降及全身衰竭等。临床分腺鼠疫、肺鼠疫和败血症型鼠疫，三个类型。
各具其特征性表现。
1. 腺鼠疫： 最为常见，除有发热和全身毒血症症状外，主要表现为急性淋巴结炎。病初即有淋巴结肿大且发展迅速，淋巴结及其周围组织显著红、肿、热、痛 ， 于病后 2-4 日达高峰。腹股沟淋巴结最常累及，依次为腋下、颈部，多为单侧。若治疗不及时，淋巴结很快化脓、破渍 ，于3-5日内因严重毒血症、休克、继发败血症或肺炎而死亡。
2. 肺鼠疫： 可原发或继发于腺鼠疫。起病急，高热及全身毒血症症状，很快出现咳嗽、呼吸短促、胸痛、发生甘、咳痰，初为少量黏液痰 ， 继之为泡沫状或鲜红色血痰 ， 肺部仅听到散在湿啰音或胸膜摩擦音 ， 较少的肺部体征与严重的全身症状不相称。常因心力衰竭、出血、休克等而于 2-3 天内死亡。临终前患者全身皮肤发绀呈黑紫色，故有 " 黑死病 " 之 称。
3. 败血症型鼠疫： 多继发于肺鼠疫或腺鼠疫，为最凶险的一型。起病急骤，寒战、高热或体温不升，谚妄或昏迷，进而发生感染性休克、 DIC 及广泛皮肤出血和坏死等，病情发展迅速 ，如不及时治疗常于 1-3 天死亡。
4. 其他类型鼠疫 如皮肤鼠疫、脑膜型鼠疫、肠鼠疫、眼鼠疫、扁桃体鼠疫等，均少见。
