根据青椒喜温、喜水、喜肥及高温易得病，水涝易死秧、肥多易烧根的特点，在整个生长期内的不同阶段有不同的管理要求。分四个阶段进行。
1、采收前的管理
青椒定植后，前期地温低，根系吸收能力较弱，应采取“大促小控”措施。即浅浇水，早追肥，。勤中耕，轻蹲苗。定植水后见干湿时要及时中耕，松土，增加地温，促进根系生长。8-10天后，再浇第二水，并进行深中耕（约7厘米），近根处稍浅，距植株远处要深，以增加土壤的通透性并起增加土温的作用。如果幼苗发黄，生长势弱，可适当轻施肥（结合第二水进行）。每亩随水追施腐熟人粪尿500公斤或尿素7—8公斤，也叫控苗肥。目的就是争取缓苗发根早，提秧生长快。第二次浇水中耕后开始蹲苗，即控制水分，促使根系向纵深发展，达到根深叶茂，如果此阶段水肥过多，容易引起植株徒长，坐果率降低。蹲苗期一周左右即可。
近年来，青椒连年减产，蹲苗期过长是一个原因，甜椒进入盛花期，其开花坐果与空气湿度有关，因此蹲苗结束后及时浇水不仅可增加土壤湿度，也可增加田间的空气湿度，有利于开花坐果。第一层果实长到蚕豆大时，植株茎叶和花果同时生长，要及时浇水和追肥，每亩施腐熟人粪尿500—1000公斤或（速效）尿素10—15公斤，同时配合施些磷钾肥，促使秧苗健壮，防止落花落果。施肥后地皮见白时及时中耕，改善土壤的通透性，并提高土壤的保肥能力。
2、盛果期的管理
盛果期气温逐渐升高，降雨量逐渐增多，病虫害陆续发生，是决定产量的关键时期，如果前．期生长不良，中期又管理不好，则秧苗生长停滞，病毒病很快发生，果实不肥大，产量迅速下降，严重时秧苗发黄、萎缩，几乎得不到产量。为防治早衰，要及时采收门椒，及时浇水，保持土壤湿度，促秧攻果，争取在高温季节前封垄。封垄前应培土保根，并进行施肥。
3、高温雨季的管理
地表温度过高会抑制青椒根系的正常生长。因此要经常保持地面湿润，浇水要采取勤浇、轻浇的方法，即每次浇水量不宜过大，而浇水间隔天数要短，保护根系越夏，以便高温过后恢复植株生长，出现第二次开花坐果高峰。
青椒根系怕涝，忌积水。雨季中土壤积水数小时，青椒根系就会窒息，植株萎蔫，形成沤根死秧。因此，在雨季前要疏通排水沟，使雨水及时排掉。暴晴天骤然降雨，或久雨后暴晴，都易造成土壤空气减少，引起植株萎蔫。因此，雨后要及时浇清水，随浇随排，以降低土壤湿度，增加土壤通透性，防止根系衰弱。
4、结果后期缓秧复壮管理
高温雨季过后，8—9月份气温凉爽，日照充足，开始逐步适合作物生长，是青椒第二次开花坐果的高峰时期，所以要加强肥水管理，促使发新枝，多结果，增加后期产量，追肥可与浇水交替进行，浇1—2次清水后追施一次速效性化肥，每亩10—15公斤，隔7—8天浇一水。也可追施腐熟过的粪稀水。
