冷浸水田的特点是水分过多，土壤中的空气过少，土质冷凉，影响土壤微生物活动，所以有效养分含量低，并因经常处于还原状态，水稻根系生长发育不良，致使前期生长缓慢，分蘖少。后期随着气温的上升，有机质矿化迅速，又易促进水稻过量吸收养分，使植株猛发徒长，诱发稻瘟病和延迟出穗而影响产量。因此，冷浸田施肥要掌握的原则是：早追施返青肥，适当控制后期施肥，防止贪青晚熟及成熟度低；增磷补锌。冷凉条件下水稻吸磷受阻，因此要增加磷肥的施用量，同时补充锌肥。
