病害是影响冬季马铃薯产量和种性的重要因素之一，现将云南省冬季马铃薯主要的病害及防治方法介绍如下：
病毒病 防治方法：选用抗病毒品种和脱毒种薯；拔除田间病株；及时防治蚜虫。
真菌性病害 一是晚疫病。防治方法：选用抗病品种及无病种薯；及时拔除中心病株和进行中耕除草；药剂防治。二是早疫病。防治方法：选用抗病品种；药剂防治。
细菌性病害
环腐病防治方法：选用抗病品种和无病种薯；发现病株时及时清除；实行轮作，注意防治地下害虫。青枯病防治方法：农业防治主要是：合理轮作。选用无病、抗病品种，防止病烂薯混入肥料，增施磷、钾肥，清除田间杂草，发现中心病株及时拔除，病穴用石灰消毒、低洼地及时排水：用50％琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液或14％络氨铜水剂400倍液灌根，每隔7～10天灌一次，连续灌2～3次。软腐病防治方法；农业防治措施包括收获前加强中耕培土，注意田间排水；成熟块茎在收获和装运过程中，避免手工和机械损伤。黑胫病防治可用敌克松7.5kg/hm2或病克净400倍液拌种，或叶面喷施0.1％硫酸铜溶液。防治疮痂病可用18％代森锰锌粉剂处理种薯或熏蒸土壤，或用不加温的福尔马林200～250倍液浸种20～30分钟，浸后捞出闷6～8小时。
