然而，投资者都对巴菲特在金融危机最糟的时期再次向高盛公司投资50亿美元的举动感到震惊。只有高盛是巴菲特一直在打交道的投行，因为高盛的一位银行家自2002年以来成功地向他推荐过数家收购目标而赢得他的信任。基于巴菲特的声望，高盛因此随后又融到一笔50亿美元的资金，达到高盛管理层当初期盼融资数量的2倍。这也是美国最值得信赖的投资者在公开力挺联邦政府挽救华尔街计划的举动。
直率地批评企业CEO贪婪的巴菲特的年收入仅仅是区区的10万美元。他几乎是在让所有伯克希尔全资控股的企业经理们来决定自己的收入，后者也常会把收入定得偏低。但巴菲特对参股的公司则有完全不同的态度。伯克希尔参股的富国银行CEO，能通过行使股票期权使年收入达上千万美元，并反对将期权列入公司成本的会计处理方式。这与巴菲特看法相左，但这丝毫未伤害两人的关系。
巴菲特是一位严格遵守职业道德的投资者。伯克希尔投资的西北银行1998年在收购富国银行时，巴菲特拒绝西北银行 CEO，也即当今富国银行CEO告诉他任何有关收购的信息，以避免被监管机构列为内幕交易者。一旦变为此身份，它会对伯克希尔业务带来巨大损失。
穆迪和其他评级机构因对令人生疑的按揭贷款证券的信用评级标准太松弛，而被外界指责是此次金融危机的始作俑者之一。巴菲特2009年3月投资穆迪的股权已超20%。然而，有数位评级机构的分析师质疑，巴菲特为何不在公司董事会上就收紧信用评级标准问题提出批评，或公开表示自己的态度。的确，巴菲特是有责任谴责危及全球金融体系的虚假评级并公开提出警告的。
有内幕消息的穆迪前员工称，巴菲特不是一位对穆迪很操心的投资者。另一位穆迪的内幕人士爆料确认，包括CEO在内的公司高管与巴菲特并不举行定期会晤，在企业治理和业务发展上也未征询过他的意见。按法律规定，穆迪应与巴菲特保持距离，因两者间有利益冲突，特别是穆迪在对与伯克希尔有业务关系的企业做信用评级时。
到2010年3月，穆迪股价已跌去50%以上，同时它在2009年4月也将伯克希尔AAA的最高评级下调一级。巴菲特2009年7月开始出售穆迪的股票，至此已卖掉了约三分之一的所持股权。
巴菲特虽对穆迪的经营不管不问，但对可口可乐确是耳提面命。当公司前CEO不幸因患癌症去世、后继者不久又退休的情况下，巴菲特忙着张罗为可口可乐寻找新CEO。他曾尝试让退休的前通用电气CEO韦尔奇来稳定陷入乱局的可口可乐。当公司业绩下滑时，巴菲特更是直接介入公司的日常经营业务。直到业绩有好转，他才与公司高管层的关系变得亲近些，并于2006年退出董事会。但伯克希尔仍持有占比达8.6%的2亿股股份，市值大约为110亿美元。
巴菲特在2008年4月开始大规模投资铁路运营商Burlington Northern。在亲自实地调研了公司的运营情况后，他最终决定将伯克希尔持有Burlington Northern的股权增至22%。他认为，随着美国经济逐步转好，未来从亚洲进口的商品会继续让铁路运输保持增长。该公司还是全美最大煤炭运输企业，业务占公司销售总收入的五分之一。他同时还认为，即使美国向清洁能源转移，但整个世界还会继续使用煤炭。
巴菲特也喜欢听美言，这正是Burlington想要给他的。公司的CEO将铁路运输方式称之为是大商品、批发、消费和国际贸易流的窗口。这与巴菲特以往接触企业具体产品和服务项目不同，投资Burlington将让他能比许多人更多地直接掌控美国宏观经济层面的信息，其了解的时间甚至会比美联储主席伯南克更早。
巴菲特之所以能将赌注押在Burlington，部分是因他出于对这位CEO的信心。若一切顺利，两人间的交道会是长期友善和互利的。犹如巴菲特的一位朋友所言，为他工作的人都能与他有温暖、密切和私人的关系，但工作关系结束之日，也就是纯粹生意关系之时。
