根据内蒙古自治区鄂尔多斯市机构编制委员会《关于鄂尔多斯市所属事业单位机构编制“五定”方案调整的批复》精神，在撤销鄂尔多斯市食品化妆品监督所的基础上，组建鄂尔多斯市食品药品稽查支队，并于2015年3月1日正式履行职能。
市食品药品稽查支队的职责是：承担全市食品、药品、医疗器械、化妆品生产、流通和餐饮服务的监督管理与稽查工作；组织查处食品、药品、医疗器械、化妆品质量安全事故；查处或移送全市范围内的食品、药品、化妆品、医疗器械违法案件；承担食品、药品、医疗器械、化妆品广告的监测和移送工作；互联网违法违规食品、药品、医疗器械、化妆品信息服务和交易行为的查处工作；承担全市食品、保健食品、药品、医疗器械、化妆品安全质量投诉举报的受理、转办、核查和处理情况的回复以及有关业务咨询工作，管理12331投诉举报信息平台；指导和监督各旗区的稽查执法、产品召回和案件查处工作。
