食品加工场所指食品生产加工车间，尤其是加工直接入口食品的车间。这些加工场所内空气的卫生质量及微生物是造成食品污染，合格率下降的主要原因。
对这些场所空气的消毒方法主要有：空气过滤、紫外线消毒和熏蒸三种。
（一）、空气过滤
空气中的微生物通常附着于微小的尘埃上、小水滴（雾滴）内。过滤机制主要是空气中的微生物（尘埃、水雾滴）等随空气中的微粒被吸附于滤材上，或由于重力作用沉淀而黏附于纤维（滤材）上，或由于静电作用（纤维带有静电）空气中的微粒被吸附于滤材上。空气过滤使用的过滤介质其孔隙小于细菌或孢子，空气通过时，微生物被阻留在介质一侧。有的过滤介质的孔径间隙大于微生物，为了达到所谓的除菌效果，介质必须有一定的厚度，发挥对空气中的颗粒的拦截作用。
食品制造中，特别是包装工序，应该进行无菌（净化）包装时，要求有净化的环境（净化室），其中的净化装置对空气的净化效果是十分明显的。这种净化室是把经过过滤后的空气再净化，进入特定的环境，经杀菌后的食品进入该环境冷却后包装。这里的食品净化环境相当于实验室内的超净工作台，可做到无菌包装。
而今年来随着NICOLER杀菌技术的广泛运用，给国内大部分的中小型企业带来了福音。NICOLER杀菌技术同样是针对空气进行杀菌过滤的一种科学技术，以其成本低廉、效果显著受到了广大食品企业的亲睐。食品动态（NICOLER）消毒技术作为控制微生物污染的措施之一。目前主要运用于各食品企业车间内进行杀菌消毒，适用企业包括烘焙类、水产品类、冷冻食品类、米面粉制品类、糖果制品类等等相关食品企业。适用车间主要为冷却车间、烘干车间、灌装车间、内包车间等。主要对车间内部所含空气进行持续净化，由于NICOLER动态空气消毒机运作机制特殊，不产生对人体有害情况。所以可边开机边消毒边工作，可以达到人机工作业的一种工作环境，深受广大食品企业的亲睐。
（二）、紫外线杀菌
目前所使用的紫外线杀菌灯是以253.7nm波长紫外线。紫外线是一种低能量的电磁辐射，照射能量能产生激发作用。紫外线照射杀菌是使微生物细胞内核酸、原浆蛋白和酶发生化学变化而死亡。紫外线有广谱杀菌作用，可杀死包括细菌、结核杆菌、芽孢和真菌在内的多种微生物。
紫外线杀菌必须选择合适的波长并需要有足够的杀菌时间，紫外线的穿透能力差，因此必须直接照射到微生物表面或物体表面才能起到杀菌作用。由于紫外线可以透过澄清、透明的水，因此可以用于生产用水的消毒。另外，紫外线的杀菌效果受到温度（适宜温度20-40 ℃），湿度（60%以下）、悬浮物、有机物等的影响。
紫外线对人体有害，此类装置仅适用于无人在的情况下使用。紫外线对物体表面杀菌具有特殊意义，如食品加工所使用的工作台面、容器及必须进行消毒的纸张、衣物的表面均可以使用紫外线实施杀菌消毒。但紫外线穿透性能差，仅能杀灭直接照射到的微生物，对照射不到的部位没有杀菌作用。对工具、物体表面事实消毒时，必须洗净除去污物，否则杀菌效果就要降低。安装紫外灯应距离被消毒物1米左右，消毒有效区为灯管周围1.5-2米处，时间为30分钟。
（三）、熏蒸消毒
熏蒸消毒是利用消毒药物气体或烟雾，在密闭空间内进行熏蒸达到消毒目的。该方法既可用于处理室内空气（污染的空气），亦可用于处理污染的表面。食品生产经营场所应定期实施熏蒸消毒，以保证生产场所及空气的清洁。
目前国内使用这种消毒方式的已经逐渐减少，因其消毒后副作用持续时间较长（异味、有毒气体等）不利于企业生产效率，企业生产量大幅度减少，是其最大的弊端。
（四）臭氧消毒
1.臭氧消毒的机理
臭氧是人类已知的仅次于第二位强氧化剂，臭氧在一定浓度下能与细菌、病毒等微生物产生化学氧化反应。臭氧有很高的能量，所以很不稳定，在常温、常压下分子结构易变，很快自行分解为氧（O2）和单个氧原子（O）。单个氧（O）具有很强的活性，对细菌、病毒等微生物有较强的氧化作用。
臭氧能氧化分解细菌内部氧化葡萄糖所必须的葡萄糖氧化酶，并直接与细菌、病毒发生作用，破坏其细胞器和核糖核酸，分解DNA、RNA、蛋白质、脂质类和多糖等大分子聚合物，使细菌的物质代谢生长和繁殖过程遇到破坏。还可以渗透细胞膜组织、浸入细胞膜内作用于外膜脂蛋白和内部的脂多糖，使细胞发生通透性畸变，导致细胞的溶解死亡，并且将死亡菌体内的遗传基因、寄生菌种、寄生病毒粒子、噬菌体、支原体及热原（内毒素）等溶解变性死亡。综观无菌技术对微生物作用的原理可分为抑菌、杀菌和溶菌三种。臭氧灭菌消毒属于溶菌剂，即可以达到“彻底、永久地消灭物体内部所有微生物。”
臭氧对人有毒，国家规定大气中允许浓度为0.2mg/m3，故消毒必须在无人条件下进行。臭氧为强氧化剂，对多种物品有损坏，浓度越高对物品损坏越重，可使铜片出现绿色锈斑、橡胶老化，变色，弹性减低，以致变脆、断裂，使织物漂白褪色等。使用时应注意，臭氧对人体呼吸道粘膜有刺激，空气中臭氧浓度达1mg/L时，即可嗅出，达2.5-5mg/L时，可引起脉膊加速、疲倦、头痛，人若停留1小时以上，可发生肺气肿，以致死亡。故在无人条件下进行消毒，消毒后停30-50分钟进入便无影响。消毒后30-60分钟臭氧自行分解为氧气，其分解时间内仍有杀菌功效，故消毒后，若房间密闭仍可保持30-60分钟。臭氧杀菌主要依靠其强氧化性，故易于精密电子医疗设备、金属等医疗环境下很多物质进行化学反映，产生对人体有害的化学物质，直接污染病人。同时高浓度臭氧是对人体有害的，所以必须在无人环境下使用，且人长期在臭氧环境下会致癌。属静态消毒。
目前国内对食品车间内空气消毒的方式比较落后，综上所述推广并使用NIOCLER动态消毒技术已成为必然的趋势，其结合静态杀菌（紫外线、臭氧）后的效果能满足大部分食品企业生产卫生的需求。
