对于《速冻面米制品》食品安全国家标准为何允许金黄色葡萄球菌的存在，卫生部解释说：金黄色葡萄球菌广泛分布于空气、土壤中，人和动物是主要携带者，通常存在于50%或更多健康人群的鼻腔、咽喉、头发和表皮中，对热敏感，一般烹饪煮熟即可杀灭。金黄色葡萄球菌食物中毒主要是由其产生的致病性肠毒素导致的，通常在金黄色葡萄球菌大于105菌落数/克时可能产生致病性肠毒素，引起食物中毒。速冻面米制品在-18℃以下保存时，不利于金黄色葡萄球菌繁殖和产生肠毒素。
卫生部还表示：国际食品微生物标准委员会根据致病菌及其致病风险，将金黄色葡萄球菌列为一般性危害致病菌，通常采用三级采样方案。三级采样方案具体意义是：规定同一批次产品采样数(n)、微生物指标可接受水平的限量值(m)、最大可允许超出m值的样品数(c)、微生物指标的最高安全限量值(M)。新标准采用了三级采样方案，用多个样品定量检测结果进行综合判定，具体规定为：生制速冻预包装面米制品中金黄色葡萄球菌限量为(n=5， c=1， m=103菌落数/克，M=104菌落数/克)。熟制速冻预包装面米制品金黄色葡萄球菌为(n=5， c=1， m=102菌落数/克， M=103菌落数/克)，即在同一批次采5个样品，允许全部样品检验值小于或等于102菌落数/克，允许1个样品检验值在102菌落数/克至103菌落数/克之间；不允许有样品检验值大于103菌落数/克；不允许2个及以上样品检测值大于102菌落数/克。
