农民专业合作社法实施3年来，我国农民专业合作社发展迅速。截止到2010年3月底，全国依法登记的农民专业合作社达27.25万个，是2008年同期的6倍多，实有入社农户达2300多万户。前不久，我们对重庆市、辽宁省和黑龙江省的农民专业合作社发展情况进行的调研显示，农民专业合作社在新农村建设中发挥着越来越重要的作用，但也存在一些需要认真研究解决的问题。
日益显现的作用
发展农民专业合作社，是农业生产关系的重要变革，为农村各项建设提供了有效载体。从调查情况看，农民专业合作社的作用正日益显现。
促进现代农业发展。现代农业实行规模化经营、标准化生产，这就对发展农民专业合作社提出了客观要求。农民专业合作社是推动农业经营体制机制创新、提高农业生产和农民进入市场组织化程度的重要载体。如重庆市某粮食合作社，实行“土地入股，统一服务”，统一配送优质水稻品种、统一垫支生产成本、统一技术服务、统一收购粮食，实现了粮食生产的规模化、标准化，并打造了两个“绿色食品”品牌，提高了农民种粮效益。
促进农民共同致富。依靠农民专业合作社，推动农业产业化从“龙头企业+农户”向“龙头企业+专业合作社+农户”转变，不仅可以解决农产品卖难、农产品加工增值等问题，而且可以进一步发挥农民的主体作用，促进农民就业增收和共同富裕。这是对农业产业化经营的完善和创新。特别是“合作社办企业”，尽管目前数量还不多，但代表着农民专业合作社发展的方向。采用这种形式，农民既可以在生产经营中增加收入，也能够从加工、销售增值中获得利润，真正形成“风险共担、利益共享”的机制。如重庆市綦江县某花生合作社，在合作生产的基础上办起花生加工厂，为社员增加收入40多万元。
提高涉农项目效益。农民专业合作社是农民自己组建的联合体。把有条件的农民专业合作社作为承担涉农项目的主体，能够提高涉农项目的效益，使广大农民直接受益。如重庆市涪陵区某大米合作社2009年承担了全区水稻高产及病虫害统防统治项目，获得项目补助资金40万元，用于购置设备、技术培训和农民劳务补助，合作社水稻种植户每户增收700元左右。
改善农村社会管理。农民专业合作社既有经济功能，又有社会功能、文化功能和教育功能；既是农村经济组织，又是农民自我教育、自我管理、自我服务的平台。如辽宁省瓦房店市某果业合作社，发展农民社员3000多人，每年都举办多种形式的文娱活动，丰富社员的业余生活。实践表明，凡是合作社搞得好的地方，社员不仅可以在经济上受益，而且可以在民主意识、合作意识、文化意识、守法意识等方面得到提升。
目前存在的问题
目前，农民专业合作社虽然发展势头很好，但还处在初级阶段，整体水平不高，规模普遍较小，带动能力不强。
内部制度不健全，运行不规范。这主要表现为：一是产权制度不明晰，部分合作社的资产没有得到明确界定。二是民主管理制度不落实，不能真正按章程办事。部分合作社没有建立规范的财务制度和会计账簿，只有内部收支流水账。三是盈余分配不规范。很多合作社没有进行盈余返还，有的虽然进行了盈余返还，但返还比例没有达到农民专业合作社法的要求。
缺人才、缺资金、缺建设用地。一是农民专业合作社中懂技术、善经营、会管理的人才不多。二是资金实力弱，缺乏可抵押资产。如辽宁省法库县某葡萄专业合作社想投资建温室大棚，发展禽肉深加工，但受制于贷款难而无法实现。三是农民专业合作社配套设施用地难的问题已成为发展瓶颈。如辽宁省法库县某食用菌专业合作社准备建设一座冷藏库，由于没有征地指标而无法开工。四是超市收取的费用过高，农民专业合作社难以承受，影响了二者的对接。
培训严重滞后。农民专业合作社运行不规范的一个重要原因，就是农民不知道怎样管理和运营合作社，缺乏管理人员、财会人员、营销人员，其根源则在于农民专业合作社的培训工作严重滞后。据辽宁省统计，全省1万多家合作社及相关指导服务部门，急需培训的人员约2万多人，还不包括大量的普通社员。培训工作跟不上，直接影响了合作社的发展。
