2009年5月20日，媒体报道甲型H1N1流感病毒在全世界确诊的感染者突破1万人。
与此同时，一场事关40亿元资金的防治流感重大国家专项的论证会也在北京某宾馆紧急进行中，专项何时发布，不得而知。
此前，国务院总理温家宝5月5日主持召开国务院常务会议，宣布将投入50亿元防控甲型H1N1流感，同时要求地方政府也要进行相应的资金投入。
如果按照通常的发达地区一比一匹配、欠发达地区由中央财政买单的原则，加上地方政府的投入，全国预防甲型H1N1流感的资金投入总数有望达到七八十亿元。
目前，《科学新闻》尚无法获知这次甲型H1N1流感防治专项经费分布的梗概，所咨询的大多数与流感病毒或者传染病防治相关的科研人员及其机构均不知道本领域相关经费的分配计划，也没有一个研究人员表示已经有研究经费到账。
但一位从事传染病研究的消息灵通人士透露，在50亿元流感防控资金中，国家将启动40亿元的重大专项。而该专项的具体分配，仍在论证过程中。
医药重大专项之惑
为一种传染病设立重大专项，在中国的科研环境中并不多见。
在2003年的SARS防治中，中央财政建立了20亿元防治基金，而地方财政投入也达到数十亿。但当时并未设立重大专项。
与常规的传染病防治项目相比，所谓大专项可能会聚焦于某几个关键领域，在一定时间内集中资金力求取得突破。
从2008年开始，中国开始陆续启动《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020)》中确定的16个科技重大专项。
新华社2008年11月报道称，到2020年，国家9个民口重大科技专项预计共投入6900亿元，其中中央财政投入2000多亿元。这9个民口专项中，涉及医药卫生领域的是“重大新药创制”和“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”两项。
其中，“重大新药创制”专项2009年5月5日在北京正式启动实施，“十一五”(2006-2010)期间已确定970项课题，课题经费53亿元人民币，共设置创新药物研究开发、药物大品种技术改造、创新药物研究开发技术平台建设、企业新药物孵化基地建设和新药研究开发关键技术研究等5个项目。但该专项主要针对癌症、心血管疾病、神经退行性疾病、糖尿病和精神健康等10种疾病，并未涉及流感的项目。
而“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”专项虽然使用了“等重大传染病”字样，但是该专项主要针对艾滋病、病毒性肝炎和结核病，计划开发针对这些疾病防治的关键技术平台、临床科研网络与应用中医药防治的方法与路线，此外也涵盖了重大传染病规模化现场流行病学和干预研究以及传染病防治综合示范区等内容。在有关“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”专项的多个招标文件中，通篇没有提到“流感”二字。
目前，上述两个重大专项的已中标课题组和所获研究经费等信息仍未对外公布。
