“十一五”以来，四川省按照“整体设计、优势集成、重心前移、重点突破、动态管理”的思路，由省科技厅牵头组织开展全省农作物及畜禽育种攻关工作，着力推进突破性新品种选育、良种良法配套和良种产业化，取得显著成效。
一是新品种选育取得重大突破。坚持引进和自主选育相结合，共育成农作物新品种239个，其中：水稻62个、玉米39个、麦类34个、薯类10个、油料33个、棉麻15个、蔬菜18个、其它28个。 “高产、稳产、优质小麦品种川麦107及其慢条锈性研究”获得国家科技进步二等奖，“K型杂交稻的选育与推广” 、“优良牧草种质资源挖掘、新品种选育及应用”、“大恒优质肉鸡育种研究与应用”等获得四川省科技进步一等奖。一丰8号、金优527、D优202被国家农业部认定为超级稻。绵杂麦168是我国继绵阳32之后第二个具有完全自主知识产权的杂交小麦新品种。育成四川省第一个高强力优质抗病棉花新品种川棉优2号、全球最早熟椪柑新品种中岩早、四川省第一个耐热萝卜新品种蜀抗7号。大恒优质肉鸡、瘦肉型肉鸭、肉毛兼用型绵羊、肉乳兼用牛等正积极申报国家品种审定。
二是育种材料与方法持续创新。“西南地区玉米杂交育种第四轮骨干自交系18-599和08-641”获得国家技术发明二等奖，“优质高配合力重穗型杂交水稻恢复系绵恢725的选育和应用”获得国家科技进步二等奖，“麦类基因资源发掘和利用研究”、 “棉花高抗枯黄萎病抗源52-128、57-681的持久抗性研究与应用” 、“食用菌种质资源收集、创制与综合开发利用”、“猕猴桃育种新材料”等获得四川省科技进步一等奖。世界首创特殊抗虫棉花不育系Mar，国际上首次获得枇杷单倍体材料和遗传多样性群体，世界首创抗虫稳定核不育二级法棉花杂种生产体系，国内首创豇豆新品种杂交培育法。在国内首次开展了在选择方案中优化利用多QTL信息的理论研究，创建了居国际领先水平的优质肉鸡育种规划方案。
三是良种产业化稳步推进。培育壮大了一批良种产业化龙头企业，涌现出国豪种业、川农高科、川种种业、川单种业、正红种业、华丰种业、铁骑力士、大恒家禽等一批科技型种业企业。据统计，四川省年销售种子收入5000万元以上的企业已达10余家，在全国种子企业“50强”中四川占有6家，具有进出口经营权的种子企业达17家，中小型种子经营企业150多家。全省杂交稻种子交易已占全国省际间种子交易总量的40%，每年向省外售种4000万公斤左右，出口1000万公斤以上。大恒优质肉鸡近两年在省内外已推广父母代60万套（繁殖生产商品肉鸡7200万只），直接推广商品代600万只。
四是育种攻关创新平台不断完善。按照“开放、流动、协作、竞争”的机制，在“十五”的基础上，农作物育种攻关设置了水稻、麦类、玉米、薯类、油料、蔬菜、果树、茶树、花卉、林竹、饲草、药材、蚕桑、棉麻及品种资源、抗性鉴定、信息服务、区域试验、栽培技术等19个课题，畜禽育种攻关设置了猪、羊、兔、牛、肉鸡、水禽、珍稀鱼类、冷水鱼类、遗传资源等9个课题，育种攻关创新平台不断完善。课题有效整合了优势产、学、研单位，构建了育种攻关创新团队，实现了大协作、大联合。
