三鹿牌婴幼儿奶粉事件发生后，农业部按照中央的部署和要求，迅速行动，采取了一系列有针对性的措施。孙政才部长多次主持召开紧急会议，专题研究，积极应对。农业部即时成立了应急响应农业部工作组，立即下发《农业部关于进一步加强生鲜奶生产质量安全监管的紧急通知》，并迅速派出了6个奶业生产督导组赶赴河北、内蒙古、黑龙江、新疆、山东、河南等奶业主产省区开展督导工作。会同有关部门迅速研究扶持奶业生产发展的政策措施。
针对目前一些企业停收限收生鲜牛奶，部分地区出现奶农倒奶现象，并呈扩大蔓延趋势，给奶农造成严重损失。9月21日，农业部进一步紧急部署，要求各级农业和畜牧兽医部门坚决按照党中央和国务院的部署和要求，采取更加有效的措施，维护奶农合法利益、保护奶农的生产积极性，确保少倒奶、坚决不杀牛。
一是千方百计组织协调加工企业扩大生鲜奶收购。各级农业和畜牧兽医部门要把保证生鲜奶的销售作为迫在眉睫的当务之急，最大限度地减少奶农的经济损失。要督促乳品企业履行生鲜奶协议，执行合同。要推动各级地方政府积极研究制定扶持企业增加生鲜奶收购数量的补贴政策，重点解决因部分企业停产减产给奶农造成的销售困难。充分发挥奶业协会和合作经济组织的作用，维护生鲜奶收购秩序，防止个别企业在收购中压级压价。想方设法调集检验检测设备，积极配合相关部门做好生鲜奶的入厂检验工作，提高检测效率和入场速度。
二是切实加大政策扶持和生产救助力度。针对当前奶业生产中面临的突出问题和实际困难，各级农业和畜牧兽医部门要在当地政府领导下，积极协调有关部门，切实加大奶业生产的扶持力度，出台救助奶农补贴办法，加紧落实奶牛良种补贴、优质后备母牛补贴和奶牛标准化规模养殖等已有的扶持政策，采取多种形式帮助奶农渡过难关，巩固奶业发展基础。
三是全面加强奶业生产动态监测和宣传引导。各级农业和畜牧兽医部门建立24小时值班制度，认真落实动态信息日报要求，密切关注生鲜奶生产、收购以及乳制品加工、销售情况，及时配合有关部门处置各种突发事件。充分利用媒体，加强对奶农和奶站经营者的宣传教育，切实提高质量安全意识。
四是深入基层和生产一线开展技术指导和服务。各级农业和畜牧兽医部门组织专家和技术人员，进场入户开展技术服务，提高奶牛养殖场户的饲养管理水平。加强对散养户和小规模户的技术培训，引导奶农向标准化规模养殖方向发展。根据当地实际情况，制定和推广安全、适用的饲料配方。指导奶牛规模养殖场、养殖小区建立健全投入品记录和疫病防治记录等养殖档案，为质量监管提供追溯依据。加强奶牛疫病防控，加大免疫力度，强化疫情监测。
五是切实加强组织领导和督促检查。各级农业和畜牧兽医部门要把确保奶农利益、稳定奶业生产作为当前工作的重中之重，主要领导同志要亲自抓、负总责。要立即启动应急机制，成立专门工作组织，明确责任，强化协调配合，把工作做实。要进一步明确责任分工，加强督促检查，落实问责和追究制度，对工作不力的要追究责任。农业部将进一步加强各项政策措施落实情况的督导，及时通报各地进展情况和存在的问题。
