我国的畜禽屠宰加工企业主要以农产品活牛、活羊、活猪、活禽为原材料，产品为肉类产品，是城乡居民日常生活的主要食品。目前，我国畜禽屠宰加工配送环节征收的税费过多、征收标准不统一、税费征收不尽合理的问题相当突出，为控制肉类产品价格，促进我国肉类产业发展，特提出以下建议：
减少税费征收项目
国家应规范畜禽屠宰加工税费征收项目，统一税费征收标准，加强税费征收管理，杜绝乱设项目、乱收费。
鉴于畜禽待宰保管、洗车、装车和肉品品质检验等项目是畜禽代宰加工服务的必备条件，其费用应纳入屠宰加工费中，不应另行收费；对畜禽定点屠宰基金、屠宰管理费、屠宰稽查费等缺少收费依据，应予以取缔和规范。
对于与公共设施建设相关的环保费、城市建设教育附加费、防洪工程维护费、堤围防护费等收费，应作为国家税收项目规范管理。
降低税费征收额度
对于国家必须征收的税费项目，要降低税费额度。
关于增值税。农产品加工企业包括初加工、深加工，初加工企业增值税进项税率为13%，销项税率为13%，而农产品深加工企业进项税抵扣13%，销项税率17%。建议：农产品加工企业税率全部按13%抵扣和征收，或恢复执行财政部、人民银行《关于商业企业批发肉禽蛋水产品和蔬菜增值税先征后退有关预算管理问题的通知》，切实减轻畜禽屠宰加工企业和消费者负担。
有的地区对代宰生猪形成的收入按“屠宰加工费”计征17%增值税。建议将“屠宰加工费”改为“屠宰服务费”，将其纳入经营服务性收费，并改征“增值税”为“营业税”，恢复到1999年以前的做法；鉴于对代宰行为的税收，属于产品流向税，应在销售环节征收，减轻屠宰环节的税负。
关于屠宰企业的肉制品在各地征收的动物检疫费。一般企业的肉制品销售需要在当地出厂时开具动物检疫合格证，同时需要缴纳金额较大的动检费，到肉品接收地还需要换成当地的动检证。
关于运输肉制品高速公路收费。一般肉制品运输采用冷藏或冷冻车辆，由于在运输过程中需要全程制冷，油耗比其他的运输成本高，生产企业将该部分费用全部加在售价中，增加终端消费者负担，建议对运输肉、蛋、奶、蔬菜等关系到居民生活食用产品的车辆采取减半或减征高速过桥费。
改进税费征收方式
目前，屠宰企业已成为多部门集中收费的场所。要改变只收费不服务和重复收费的弊端，对防疫费和产地检疫费，应坚持在生产环节征收；销售市场管理费，应坚持在市场环节征收。
关于收购农产品和销售产品印花税。根据《税法》，国家规定按合同征收，各地制定实施细则，有些省份地税局下发文件，“对不能准确提供合同采取核定征收办法”。一般来讲，农民不与企业签订收购合同，也不需要签订合同，屠宰企业销售肉制品，一般消费者直接用现金购买，不需要也不可能签订合同。地方政府为了多收税，采取“核定征收”办法，存在一些问题。
为此，建议按国家税法规定征收，各地不得变通。考虑到肉制品为居民生活必需品，为减轻企业负担，可按合同减半征收印花税。
扶持畜禽屠宰加工企业发展
一是免征初级产品所得税。根据国家新修订的所得税法中“对农副产品初级产品免征所得税”的规定，屠宰厂生产的动物胴体和分割肉属于初级产品的范围，应给予免征所得税的优惠。二是实行免费检疫、免费服务。鉴于屠宰检疫是政府行为，检疫人员是公务人员，所需费用应由国家负担。建议国家取消屠宰产品检疫费。三是实施污水处理优惠政策。目前，国家对屠宰企业污水处理建设项目缺乏统一扶持政策，有的给点补贴，有的就没有补贴。建议国家对大中型畜禽屠宰企业污水处理设施的建设给予补贴。
