一个地区的食品安全水平在很大程度上取决于食品工业化水平的程度，而我区食品工业现代化水平较低，有90%左右的食品生产经营企业是10人以下的小企业，生产技术落后，生产经营者的质量意识、自律意识、诚信意识和法律意识不强，监管难度大。受我区经济发展因素影响，地区与地区、城市与农村食品安全工作发展还不平衡，各地食品安全工作存在重城市、轻农村的倾向，农村和城乡接合部食品市场日常监管还不到位，制约着食品安全工作的深入推进。
在这些因素影响下，“两边五小”即城市周边、校园周边和小作坊、小商店、小餐馆、小市场、小摊点和农村食品市场等环节还存在较多问题，检查中常发现小商店有少数过期食品，小餐馆消毒不够规范、卫生条件差，个别种植养殖基地农业投入品使用记录不全，少数超市清真食品和非清真食品混放等现象。去年工商部门集中开展了清真食品、儿童食品、城市周边等10多项食品安全专项执法行动，取缔无照经营户多达5759户，制假售假窝点有327个之多，查处制售假冒伪劣案件达394件，假冒伪劣食品价值356万元。自治区民委在检查中，拆除了218家擅自使用“清真”字样的门头牌匾，依法查处无《清真食品准营证》和清真标牌212户。
此外，影响我区食品安全工作更深远的问题则是食品安全法律法规不健全。据了解，现行食品安全监管法律法规系统性、协调性和可操作性较差，地方法制建设工作滞后，导致食品安全监管部门间职责交叉、管理活动重复、管理行为不一致、法律实施不稳定、执法资源浪费、出现管理盲区等，影响了执法效果。食品安全标准普遍存在标准滞后、制定周期长、标准水平偏低的问题。这些问题亟待解决。
