食品包装纸（盒）与食品直接接触，如果不清洁或含有害物质，就会造成对食品的污染，直接影响人的身体健康。一般来说，目前包装纸（盒）对食品的污染主要有四种，一是微生物。用废旧书报纸包装食品，每克纸中可检出细菌10万个以上，有的还含有多种病菌、病毒和寄生虫卵。二是重金属、农药。用垃圾纸生产的纸板作食品盒，大多能检出铅等重金属及砷、苯、有机磷等毒物。三是荧光物。荧光增白剂以及工业用黄蜡，大大增加了食品包装纸中多环芳烃等有害物质的残留。四是硫化物。用未经脱硫的本白玻璃纸包装糖果，可使糖果中含有强烈的神经毒物———二硫化碳。
为防止包装纸（盒）对食品的污染，企业应做到以下几点：
一、不要使用回收的废旧报纸和书本包装食品，也不要用以垃圾纸为原料生产的纸板作食品盒，更不应用其包装直接入口的食品。
二、托蜡包装纸应使用食品级石蜡，不能使用工业级石蜡来替代。
三、印刷食品包装纸上的彩色图文，要控制油墨的化学成分，尽量做到低毒或无毒；包装食品时应将印有彩色图文的一面朝外。
要确保纸包装不对食品造成污染，不仅是包装纸品生产企业应该注意的问题，也是食品生产企业需要严格把关的问题。
