随着人民生活水平的不断提高，农产品的质量安全日益成为人们关注的热点问题。为此，《意见》提出，要积极推动建立贯穿农产品种植、养殖、加工、储运、经销全过程的质量卫生安全管理体系。在农产品生产、加工、储运、经销企业中开展质量管理体系认证、环境管理体系认证、职业健康安全管理体系认证，促进农产品生产、加工、经销企业质量管理水平的全面提高。同时，利用加入世贸组织的“绿箱”政策和借鉴国外做法，对获得农产品认证的生产、加工企业给予一定的政策优惠。
《意见》提出，在今后一段时间里，我国建立农产品认证认可工作体系的重点，就是要建立统一、规范的农产品认证认可体系，借鉴和引入工业产品认证认可的经验和做法，统一认可制度、统一认可机构、统一认可标准和认可程序，保证认可工作的公正、公开、公平，加快农产品认证工作。实行统一的农产品认证机构、认证咨询机构和认证培训机构的国家认可制度。同时，对从事农产品认证、认证咨询和认证培训等业务的机构要办理审批和登记注册，对农产品认证人员实施注册、备案制度。
除国家认证认可监督管理委员会外，联合发文的还有国家质检总局、农业部、国家经贸委、外经贸部、卫生部、国家环保总局、国家工商总局、国家标准委。
