水产品含丰富的EPA、DHA等有助身体建康，也深受台湾消费者喜爱，消费量逐年增长。儘管当局一再强调会加强对市售水产品安全把关，但是官方抽验之水产品仍然出现相当比例的动物用药残留，让消费者难以安心，毕竟再美味的水产品若缺乏安全保障消费者还是不会买单。
检视这些年台湾水产品发生食安问题主要原因在于：养殖、流通过程因环境因素导致微生物、毒素、药物残留超标；加工或食用方法不当，引起食物中毒；激素、抗生素、化学药物滥用导致残留量超标，对人体造成危害；使用违规药物如二氧化硫、一氧化碳、甲醛（福马林）、亚硫酸盐等进行漂白、保鲜、防腐；环境恶化使得水产品在生长过程中受到严重污染；产业间竞争激烈，以低价品充当高价水产品；监管不力使得品质不合格的水产品流入市场贩售等，须强化「事前积极管理」与「事后有效处理」的双重因应措施，而不是只靠提高十倍检验数量，别忘了安全水产品是靠生产部不是检验出来的。
而日本为全球重要的食鱼国家，尤其生鱼片更是日本料理的一大特色深获消费者喜爱，日本人吃掉全球近八成的鲔鱼产量，只是近来日本食品安全也如台湾一样频频出包让消费者信心大失。为确保食的安全，重拾消费者信心，日本近畿大学渔业研究实验室除了学术研究外，在日本的美食之都银座商业区以及大坂购物中心Grand Front Osaka裡头开设养殖鱼类主题餐厅（就取名为近畿大学水产研究所），该餐厅内所使用的鱼类食材如鲔鱼、真鲷、鰤鱼等，都经过该大学渔业实验室的严格检查，标榜让顾客一整年都可以品尝到安心放心的品尝美味的养殖鱼类，还贩售由该大学创全球首例完全养殖的黑鲔鱼，由于天然产黑鲔容易累积重金属，使得养殖黑鲔大受消费者欢迎，座无虚席。近畿大学还希望将该餐厅用于教育目的，让具艺术专业的学生可以设计菜单，营养专业的学生可以设计营养套餐，让学生能学以致用，这种结合海洋资源保育、水产食品卫生安全、水产经营、文创等理论与实务传授，值得提供给台湾当局及各大学在思考转型、整併、自闢财源、提高招生人数等的重要参考。
随著原料来源的全球化使得食物供应链拉长，水产品受污染的风险相对提高，尤其零售阶段不易保鲜更应列为管控的重点。为了确保消费者食用安全起见，政府除了应努力研发高灵敏、快速筛选、侦测及萃取方法来加强对进口水产品把关外，应该参考美日做法积极建构完备的水产品品质安全管控机制包括：政府监管机制、产业自律机制、生产者自控机制、消费者诉求机制和社会监督机制，彼此相互联动构成一个完整体系；同时辅导台湾捕捞及养殖水产品取得国际卫生安全与生态标章等认证，以方便消费者选购，并整合各大专院校水产相关科系人力投入水产品安全相关研发、检验、查缉、厂商辅导等工作，才能真正让消费者吃的安心。
