日本国立神经医疗研究中心对43名重度抑郁症患者和57名健康者肠内细菌对比后发现，抑郁症患者人群有益菌双歧杆菌和乳酸杆菌的数量明显少于健康人群。这一研究结果显示，有益菌少的人患抑郁症风险较高。
日本目前接受抑郁症治疗的患者约有70万人，而未接受治疗的患者据推测超过治疗者数的3至4倍，是威胁日本人健康的主要疾病之一。人们一般认为，抑郁症病因是神经递质异常、应激反应的内分泌异常以及慢性炎症等生物学原因，但对抑郁症并没有更多的了解。人类肠道有1000多种细菌，数量超过100万亿个，总重量约为1至1.5公斤。这些细菌从食物中吸收营养，合成维生素及蛋白，防止外界病原菌侵入人体，承担着极其重要的任务。
研究小组以43名抑郁症重症患者和57名健康者为对象进行了研究。他们从被试验人员的粪便中采集双歧杆菌和乳酸杆菌，用16S rRNA遗传基因逆转录定量PCR方法分析发现，抑郁症重症患者的双歧杆菌数明显低于健康者；乳酸杆菌总菌数也同样偏低。在有关分析中，双歧杆菌临界值（每克粪便中109.53个）以下的抑郁症重症患者人数比为49%（21/43人），健康人群为23%（13/57人），每克便中双歧杆菌数少于109.53个时，抑郁症重症患者发病风险增加3倍；乳酸杆菌数量在每克便中少于106.49个时，抑郁症重症患者发病风险增加2.5倍。研究小组还发现，在被试验者中，并发过敏性肠综合征的比率在抑郁症重症患者中明显增高。
这份刊登在《情感障碍》杂志网络版的研究成果，首次报告了有益菌数量少易导致抑郁症发病风险增加，也发现过敏性肠综合征这种应激性身心病也与有益菌有关。乳酸菌饮料和酸奶等益生菌的摄取可能对抑郁症的预防和治疗有效。
