由于对跨境电商类企业通关等体系建设存在空白，相关企业按一般贸易流程通关存在障碍，对于那些正面清单之外的部分产品影响尤其大。据了解，部分跨境电商平台相关货品无法通关，导致库存严重告急。
库存告急！库存告急！
跨境电商实施接近一个月，对于一些跨境电商企业来说，库存问题成为他们生死攸关的命门。
据21世纪经济报道记者了解，由于对跨境电商类企业通关等体系建设存在空白，相关企业按一般贸易流程通关存在障碍，对于那些正面清单之外的部分产品影响尤其大。据了解，部分跨境电商平台相关货品无法通关，导致库存严重告急。一些跨境电商本身的库存支撑仅1个月，很快将面临无货可卖的情况。
此外，由于实行正面清单管理，部分商品管控更为严格，集中反映配方奶粉、首次进口化妆品、部分保健食品等，由于需要去相关主管部门注册或备案等，部分企业难以适应。而部分奢侈品单价超过2000元限额，也面临通关难的局面。
通关体系存空白
4月9日，跨境电子商务零售进口税收新政实施以来，新政执行层面的一些问题显现。
21世纪经济报道记者发现，真正的问题并不在此前预期的税收问题上。据了解，跨境电商进口税收新政执行以来，部分税负相比以前虽有所提升，但这块影响逐渐被消化，更多通关执行层面的问题显现出来。
新政指出，根据相关主管部门的意见，清单内的商品将免于向海关提交许可证件，检验检疫监督管理按照国家相关法律法规的规定执行；直购商品免于验核通关单，网购保税商品“一线”进区时需按货物验核通关单、“二线”出区时免于验核通关单。
诸多企业反映通关成为“拦路虎”，保税区进关的产品，难以获得通关单。
中国贸促会研究院研究员赵萍对21世纪经济报道记者表示，他们对跨境电商企业进行调研时，发现海关通关系统针对跨境电商企业缺乏相应接口。海关没有专门为跨境电商企业辟出一条通道，而且也缺乏相应的资质标准，比如符合什么条件的企业可以走这个通道。
赵萍进一步举例，比如京东商城既有一般贸易进口，也有跨境电商零售进口，比如京东全球购就属于跨境电商进口。如果京东全球购单独出来，成立一个公司，这个公司难以从海关那直接通关，因为缺乏相关的体系和制度。
部分跨境电商企业并没有遭遇过关难的问题。广州一家主营快消品的跨境电商平台企业负责人对21世纪经济报道记者表示，他们很欢迎保税区产品纳入一般贸易监管流程，部分商品经过检验检疫入关，能将部分假货拦截住，有利于跨境电商整体生态的维护。
上述负责人也直言，从保税区入关，进行类似一般贸易的进关检验检疫等，会产生额外的一些隐性成本。因为这流程更繁琐、成本也会增加，不少企业决定加大海外直邮的业务量，来规避国内海关的监管，比如原本通过深圳、广州等保税区入境的产品，转到香港保税区仓库，相应物流成本并不会增加太多。这导致香港部分保税区仓库租金上涨了30%左右。
浙江部分跨境电商企业对21世纪经济报道记者表示，由于监管加强，很多企业转向海外直邮，国内当地的保税仓库都空了下来。
清单备注加强监管
赵萍表示，快消产品大多属于清单内的产品，没有遭遇到通关难的问题。但现在很多乳产品分中国版、欧洲版、美国版等，中国版属于清单内，其他地区版本则需要再行注册，可能就会遭遇通关难的问题。
4月7日、4月15日，财政部等13个部门分别下发了第一批和第二批跨境电子商务零售进口商品清单，分别涉及到1142个、151个税则号列，涵盖了部分食品饮料、服装鞋帽、家用电器以及部分化妆品、纸尿裤、儿童玩具、保温杯等产品。
财政部关税司有关负责人介绍，为避免工业原材料等商品通过跨境电商零售进口渠道进境，同时便于日常征管操作，政策实行清单管理。清单范围是结合跨境贸易电子商务服务进口试点情况，根据相关主管部门的意见进行汇总公布。清单中明确了商品涉及的许可证件、通关单等问题，这有利于跨境电子商务行业的规范发展。
有企业反映，上述清单未覆盖约三成热销产品。财政部对此的回应是，两批清单涵盖了跨境贸易电子商务服务进口试点期间实际进口的绝大部分商品，可满足国内大部分消费者的需求，有利于跨境电子商务在前期试点基础上继续发展。
清单列举产品的备注内容，涉及热销商品，如保健品、乳产品、化妆品等，也让不少企业陷入纠结。如“配方奶粉”在清单之列，但还附有备注条件，“按《食品安全法》规定应当实施注册而未经注册的婴幼儿配方奶粉除外”。这曾导致很多商家配方奶粉被滞留保税区内，难以通关。
随后，食品药品监督管理总局明确，根据新修订的《中华人民共和国食品安全法》，婴幼儿配方乳粉的产品配方应当经国务院食品药品监管部门注册。由于《婴幼儿配方乳粉产品配方注册管理办法》仍在制定过程中，目前跨境电子商务零售进口婴幼儿配方乳粉时，暂不需要获得相关产品的配方注册证书。
国研中心市场经济研究所所长王微对21世纪经济报道记者表示，在行业调研时，不少乳液专家提出，中国婴幼儿体质与其他国家有所不同，在婴幼儿配方奶粉上应该引入一定监管。
加强监管的还有医疗器械、保健食品、特殊医学用途配方食品等种类。如新修订的《食品安全法》规定，首次进口的保健食品应当经国务院食品药品监督管理部门注册，其中属于补充维生素、矿物质等营养物质的，应当报国务院食品药品监督管理部门备案。
至于检验检疫等环节的增加，国家检验检疫总局相关负责人对21世纪经济报道记者表示，按照国家的政策，跨境电商零售进口适用于一般贸易监管。在新政实施前，所有跨境电商零售进口适用行邮税，检验检疫是按照一般邮包进行，现在要转为一般贸易，按照一般贸易的流程来进行。
不过，新政之后，对于海外直邮的业务，仍然等同于之前邮包。
