中国首部食品安全治理蓝皮书指出，食品安全监管“九龙治水”的问题仍未解决，标准不一，“毒豆芽”案件即典型例证，同时也没制定与食品卫生标准相衔接的环境质量标准，导致很难从源头管控。
6月13日，《食品安全治理蓝皮书（2014）》（下称“蓝皮书”）在北京发布。该“蓝皮书”由中国人民大学与多家科研院所共建的食品安全治理协同创新中心编著。
“蓝皮书”显示，中国现有关于食品安全的法律虽然数量较多，但大多是不同部门在不同时期制定和颁布的部门立法、分段立法、分散立法，相互交叉重复、缺乏衔接甚至冲突严重，许多与食品安全相关的标准制定修改时间也滞后严重。“蓝皮书”建议尽快建立《食品安全法》基本法地位，并加快该法修订速度，与时俱进修正和丰富其内容。
2013年的国务院机构改革方案，明确由食品药品监督管理部门对食品安全进行全程监督，解决过去“九龙治水”、分段监管的局面。“蓝皮书”称，从目前状况看，各职能部门之间在食品安全监管方面的关系尚未完全理顺，典型的例证就是在“毒豆芽”案件中，对豆芽的监管问题至今未能明确，有关部门至今未对“毒豆芽”案件中一系列的定性和法律依据做出积极有效的回应。
澎湃新闻此前报道，因对豆芽的属性和监管存在争执，使用“无根素”制发豆芽被认为是非法添加有毒有害物质，在近年重典惩治食品安全违法犯罪的情形下，出现了一系列有争议的案件。农业、卫生两大监管部门都表示，发豆芽不归他们管，“踢皮球”引发司法混乱。
除了食品安全标准本身的问题，其与环境污染标准之间还存在非常大的制度差距。中国人民大学环境学院副教授石磊表示，“甚至可以说按照环境污染标准不是污染的，但按食品安全标准就是污染，标准的差异与缺失影响到未来食品安全。”
“蓝皮书”称，环境污染对人类健康最突出的影响表现在由环境污染引起的食品污染，土壤环境质量直接关系到农产品质量安全，进而影响食品安全。由于耕地受到不同程度的重金属农药和持久性有机污染物污染，巨量的粮食及蔬菜污染物含量超标，特别是湖南多个地区的大米镉超标问题。
对此，“蓝皮书”建议，尽快出台《土壤污染防治法》及其配套法规，加强土壤环境应急和执法能力建设，在制定土壤环境质量标准时还应注意与食品卫生标准的衔接。
中国人民大学法学院教授竺效向澎湃新闻透露，目前农业部正在修订《农产品质量安全法》，预计于2015年完成初稿并交国务院审议。初稿中有望进一步调整食用性农产品禁止生产区，并新增农产品场地污染应急管理制度。
“蓝皮书”还表示，相对于举报人的主动披露以及媒体平台的追踪报道，食品安全监管部门总显得姗姗来迟，建议加强社会监督，最主要的是建立健全有奖举报制度。
西北政法大学刑事法学院教授舒洪水将此称为“一场食品安全的人民战争”。他认为，食品安全监管应从监管机关本位改为举报人本位，落实“举报是一种权利”，将举报的主动权掌握在社会公众手中。
