在我国食品工业总产值年年攀升的同时，食品生产企业仍面临食品安全的四大挑战：
一是中国食品工业的基数大，食品安全事故发生的概率与显示度高。我国每天加工近11亿公斤的食品，日均创造着214亿元的产值，这个庞大的基数必然使中国发生食品安全事故的几率、概率与显示度增高，食品安全的“触点”增多。
二是源头污染难以避免，易于传递到整个产业链。中国要用占全球7%的耕地、6%的水源，养活占全球22%的人口，粮食安全是第一要务。农药、化肥、抗生素的使用在一些地区不可避免。同时，在工业化进程中，空气、土地、水的污染加速。因此，来自源头的污染不可避免地向下游传导，且在短期内难以有效化解。
三是分散的农业生产方式，加剧了原料溯源的难度。中国的农业分散于千家万户，而中国的食品工业在快速集中。一个大企业要面对上千家农户提供的原料，从而形成在脆弱基础上的散点式溯源，因此，在食品安全产业链的梳理中，企业溯源的难度极大。
四是快速发展中的失衡及盲目求利中的失律。中国食品工业用持续30多年的高速发展，走过了发达国家食品工业的百年历程。而食品安全事件的发生，正暴露了中国食品工业在高速成长中的致命短板。美国的《食品药品法》已有100多年的历史，仍在不断修改与完善，我国的《食品安全法》仅公布了几年，法律体系的基础相对薄弱。
处于转型期的中国，食品安全所暴露出的问题，较多地浓缩了现阶段社会发展中的急功近利及诚信缺失，在原材料价格大幅上涨的背景下，在以同质化的价格竞争为主要发展方式的前期食品工业发展中，“道德、法规、技术”三个不同层面问题叠加出现，在使企业家失信于公众的同时，亦严重败坏中国食品工业的形象，更使中国食品安全问题逐渐被演化成愈来愈失去耐心的“信任危机”。
